数据集概述
该数据集包含Paule等人2020年发表的关于凤梨科Fascicularia-Ochagavia组系统基因组学研究的相关数据，主要涵盖DNA序列比对文件、系统发育分析的数据分区方案输入输出文件等，为该类群的系统发育研究提供基础数据支持。
文件详解
- DNA序列比对文件：
- rDNA.phy、cp-dataset-2_coding.phy、cp-dataset-1_readmapping.phy：均为.phy格式，包含不同数据集的DNA序列比对数据
- cp-dataset-3_fullplastomes_before_gblocks.fasta：.fasta格式，叶绿体全基因组序列数据（Gblocks处理前）
- 数据分区方案文件：
- rDNA_PartitionFinder2_best_scheme.txt、cp-dataset-2_coding_PartitionFinder2_best_scheme.txt：.txt格式，记录PartitionFinder2分析得到的最佳数据分区方案
- rDNA_PartitionFinder2_input.cfg、cp-dataset-2_coding_PartitionFinder2_input.cfg：.cfg格式，PartitionFinder2分析的输入配置文件
- 分析日志文件：
- rDNA_PartitionFinder2_log.txt、cp-dataset-2_coding_PartitionFinder2_log.txt：.txt格式，PartitionFinder2分析的日志记录
- 其他文件：
- cp-dataset-3_gblocks_output.htm：.htm格式，Gblocks处理的输出结果文件
适用场景
- 凤梨科植物系统发育关系研究
- 植物DNA序列比对与数据分区方案优化分析
- 叶绿体基因组与核糖体DNA在系统基因组学中的应用研究
- 植物分子进化分析
