数据集概述
本数据集基于葡萄藤（Vitis vinifera）和番茄（Solanum lycopersicum）基因表达图谱及葡萄藤浆果发育转录组数据，通过整合网络分析方法识别出“fight-club hubs”及“switch genes”两类关键调控基因，揭示其在植物发育阶段转录组重编程中的作用，共包含16个文件。
文件详解
- 补充数据集文件
- 文件名称：遵循
tpc133710_SupplementalDS[编号].xlsx模式（例如：tpc133710_SupplementalDS12.xlsx、tpc133710_SupplementalDS11.xlsx）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：未提供具体字段预览，推测包含基因表达量数据、基因网络相关性矩阵、fight-club hubs及switch genes的筛选结果、基因功能注释信息、不同组织/发育阶段的基因表达差异数据等支持网络整合分析的补充数据内容
数据来源
论文“Integrated network analysis identifies fight-club nodes as a class of hubs encompassing key putative switch genes that induce major transcriptome reprogramming during grapevine development”
适用场景
- 植物发育转录组调控机制研究: 分析fight-club hubs及switch genes在葡萄藤从营养生长到成熟阶段转录组重编程中的调控作用
- 果实发育关键基因挖掘: 结合番茄果实成熟突变体数据，识别不同肉质果作物器官发育的核心调控因子
- 基因网络构建与分析: 利用多物种基因表达图谱数据，构建和验证植物基因表达相关性网络
- 转录因子功能验证: 针对switch genes中的转录因子，开展其作为发育阶段主调节器的功能实验设计参考
