数据集概述
本数据集为支持Castanea alabamensis非杂交起源的全基因组序列分型研究数据，包含北美栗属（Castanea）多个类群（含美洲栗、矮栗及亚洲栗属物种）的基因组数据，通过十万余个单核苷酸多态性（SNP）位点分析，验证了Castanea alabamensis的非杂交起源，共包含4个文件。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：Perkins_et_al._Systematic_Botany_supplemental_materials.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究补充材料文档，包含实验设计、分析方法等辅助信息
- 样本信息文件
- 文件名称：allsamples_wpopcodes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含样本编号与群体代码对应关系，如“3_6”“152_21”等样本标识
- 基因型数据文件
- 文件名称：out98copy.vcf、batch_1.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：全基因组SNP分型数据文件，记录样本在十万余个SNP位点的基因型信息
数据来源
论文“Genome-wide sequence-based genotyping supports a nonhybrid origin of Castanea alabamensis”
适用场景
- 植物系统发育研究：分析Castanea属物种的亲缘关系与进化历史
- 群体遗传学分析：探究Castanea alabamensis的群体结构与遗传多样性
- 物种起源验证：验证植物类群的杂交或非杂交起源假说
- 保护遗传学研究：为北美栗属濒危类群的保护策略制定提供基因组数据支持
