光药理学应用_光开关共价激酶抑制剂构象景观数据集

数据集概述

本数据集为光药理学领域研究提供支持，包含光开关共价激酶抑制剂相关的分子模拟数据，覆盖不同体系的参数、拓扑结构及初始/最终构象文件，用于分析其构象景观特征。

文件详解

• 文件名称: Photopharmacology_in_Action.zip
• 文件格式: ZIP压缩包
• 包含内容: 压缩包内集成以下四类分子模拟系统的相关文件（参数、拓扑、初始及最终结构文件）：
• 重氮环辛烷光开关在水中的模拟
• 光开关JNK3抑制剂在水中的模拟
• 光开关JNK3抑制剂与JNK3的ATP结合口袋非共价结合的模拟
• 光开关JNK3抑制剂与JNK3的ATP结合口袋共价结合的模拟
• 说明: 同一目录下所有模拟使用相同的参数文件（.mdp）和拓扑文件（.itp）

适用场景

• 光药理学研究：分析光开关分子在不同环境下的构象变化机制
• 药物化学研究：探究JNK3抑制剂与靶点共价/非共价结合的结构特征及作用模式
• 计算生物学分析：支持分子动力学模拟数据的复现与验证，构建激酶抑制剂构象景观模型
• 结构生物学研究：为光控药物设计提供分子水平的构象参考依据