数据集概述
该数据集包含用于核孔复合体Nup84亚复合体建模的脚本文件，展示如何结合IMP、MODELLER、PMI工具，利用286个DSS/EDC化学交联数据和电子显微镜2D类平均图像进行结构建模，提供了从组件初始结构生成到整体复合体建模的流程支持。
文件详解
- 分子动力学轨迹文件（.dcd格式）：
- clus.1.dcd、clus.1.aligned.dcd、clus.2.dcd、clus.2.aligned.dcd：共4个，存储建模过程中的分子动力学轨迹数据
- 压缩包文件（.zip格式）：
- XL_analysis.zip、nup84-v1.0.3.zip、Fig_6_densities.zip：共3个，包含交联分析数据、建模核心文件及密度图相关资源
- 压缩结构文件（.gz格式）：
- clus.1.pdb.gz、clus.2.pdb.gz：共2个，存储压缩后的蛋白质结构数据（PDB格式）
适用场景
- 结构生物学研究：用于核孔复合体Nup84亚复合体的三维结构建模与验证
- 计算生物学方法验证：测试IMP、MODELLER等工具结合交联数据与电镜图像的建模流程
- 分子动力学分析：基于轨迹文件研究Nup84复合体的动态结构变化
- 跨学科方法融合：探索化学交联数据与电子显微镜数据在大分子复合体建模中的整合应用
