数据集概述
本数据集为研究新热带区Heliconiini蝴蝶适应性辐射的多基因物种树数据，包含22个线粒体与核标记的测序数据，覆盖该族约百分之九十二的物种。数据用于分析系统发育信号冲突、比较不同物种树重建方法，并构建时间校准的系统发育树，以探究新热带区环境变化对蝴蝶多样化速率的影响，共包含五个关联文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Supplementary Information.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究相关的补充说明文档，可能包含实验方法细节、结果补充分析等内容
- 样本信息文件
- 文件名称：Online Appendix 1 Specimens.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究涉及的蝴蝶样本信息，可能包含物种名称、采集信息、测序样本编号等字段
- 分区信息文件
- 文件名称：Online Appendix 2 Partitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录由PartitionFinder确定的最优分区及替代模型信息，包含RAxML分析（每个物种多个个体）的相关分区设置
- 系统发育分析配置文件
- 文件名称：Online Appendix 3 BEAST.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST软件的分析配置文件，包含时间校准的系统发育树构建相关参数设置
- 多物种溯祖分析配置文件
- 文件名称：Online Appendix 4 starBEAST.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：starBEAST软件的分析配置文件，用于多物种溯祖方法的物种树重建参数设置
数据来源
论文“Multilocus species trees show the recent adaptive radiation of the mimetic Heliconius butterflies”
适用场景
- 蝴蝶系统发育研究: 利用多基因标记数据重建Heliconiini蝴蝶的物种树，分析系统发育关系与信号冲突
- 适应性辐射演化分析: 结合时间校准的系统发育树，探究Heliconius属蝴蝶近期适应性辐射的驱动因素
- 物种树重建方法比较: 对比超级矩阵法与多物种溯祖法等不同方法在处理异质性数据时的表现
- 生物多样性演化研究: 分析新热带区环境变化对昆虫类群多样化速率的影响，为生物多样性保护提供理论参考
- 分子系统学方法应用: 作为分子标记选择、分区模型优化及系统发育软件配置的实践案例参考
