数据集概述
本数据集包含索科特拉群岛半叶趾虎属壁虎起源与原地分化研究的分子数据,涵盖线粒体和核基因位点的单倍型序列、GenBank信息表及物种树分析文件,共10个文件,用于探究该属壁虎的生物地理历史、进化模式及种内遗传多样性。
文件详解
- 基因序列文件(.fasta格式,共9个)
- 单倍型序列文件:包括hemi_soc_prdx4_all-hap.fasta、hemi_soc_cyb_all-hap.fasta、hemi_soc_mc1r_all-hap.fasta、hemi_soc_12S_all-hap.fasta、hemi_soc_ND4_all-hap.fasta,分别对应不同基因位点的单倍型序列数据
- 物种树分析序列文件:包括hemi_arb-soc_mc1r_starbeast12_So-14sp.fasta、hemi_arb-soc_ND4_starbeast12_So-14sp.fasta,为多物种溯祖分析(*BEAST)所用的序列数据
- GenBank信息表(.xlsx格式,1个)
- 文件名称:GenBank_Gómez-Díaz_MEC-12-0197.xlsx
- 字段映射介绍:包含研究中涉及的基因序列在GenBank数据库中的相关信息,如 accession号、物种名称、基因位点等
数据来源
论文“Origin and in situ diversification in Hemidactylus geckos of the Socotra Archipelago”
适用场景
- 生物地理学研究:分析索科特拉群岛半叶趾虎属壁虎的起源(古陆块分离与跨洋扩散事件)及生物地理历史
- 分子系统学分析:基于多基因位点数据重建物种系统发育关系,探究种间分化时间与模式
- 种内遗传多样性研究:利用单倍型序列数据评估索科特拉群岛半叶趾虎属各物种的遗传分化水平与种群结构
- 进化生物学研究:探讨历史与生态因素对壁虎物种形成过程的影响,分析极端生境下的原地分化案例(如Abd al Kuri岛的H. forbesii与H. oxyrhinus)