数据集概述
本数据集包含从亚马逊蚁鸟Hypocnemis（隶属蚁鸟科）58个标本中提取的超保守元件（UCEs）和外显子序列处理文件，涵盖所有已知物种及除一个亚种外的样本。数据集分为8个子集，用于系统发育、种群结构、种间界限及生物地理历史的推断，支持不同遗传标记和分析方法的研究。
文件详解
- 文件名称：遵循
DATASET[编号]-[时间戳]-1-001.zip模式（例如：DATASET1-20250811T093919Z-1-001.zip）
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：8个子集对应不同分析目标，核心信息包括样本数、类群、遗传标记数及分析方法，例如：
- Dataset 1：59个样本，含Hypocnemis cantator复合体、Hypocnemis hypoxantha复合体及外群Drymophila genei，2222个UCEs+30个外显子，用于似然系统发育树构建
- Dataset 2：58个样本，含两种复合体，93个UCEs+7个外显子，用于溯祖物种树及生物地理历史分析
- 其他子集分别针对特定复合体或分析方法（如物种界定、系统发育网络、种群结构等）
数据来源
NCBI Sequence Read Archive（BioProject PRJNA1311538）及论文相关数据（https://doi.org/10.2139/ssrn.5215079）
适用场景
- 鸟类系统发育研究：利用不同子集的UCEs、外显子或SNP数据构建系统发育树，分析亚马逊蚁鸟的演化关系
- 生物地理历史推断：通过Dataset 2的溯祖物种树和生物地理分析工具，探究Hypocnemis属的分布历史
- 物种界定分析：使用STACEY、SNAPP等工具，基于不同遗传标记评估Hypocnemis复合体的种间界限
- 种群结构研究：通过系统发育网络、主坐标分析（PcoA）和种群结构分析（sNMF），解析亚马逊蚁鸟的种群分化模式
- 遗传标记选择方法验证：参考高信息位点筛选流程，优化鸟类遗传学研究中的标记选择策略
