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UCE_Based_大基因组蝾螈超保守元件测序与进化分析数据
2026年1月29日 30 7 3
数据集概述 本数据集为针对大基因组蝾螈（Plethodon serratus）超保守元件（UCEs）的序列捕获与下一代测序数据，包含85个样本的6亿余条测序读段分析结果，用于解析种内系统地理关系与隐存种界定，验证UCEs协议在大基因组生物研究中的适用性。 文件详解 压缩文件（.zip）...
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Hypocnemis_Based亚马逊蚁鸟分化UCEs遗传学数据集
2026年1月27日 30 87 57
数据集概述 本数据集包含从亚马逊蚁鸟Hypocnemis（隶属蚁鸟科）58个标本中提取的超保守元件（UCEs）和外显子序列处理文件，涵盖所有已知物种及除一个亚种外的样本。数据集分为8个子集，用于系统发育、种群结构、种间界限及生物地理历史的推断，支持不同遗传标记和分析方法的研究。 文件详解...
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Synbranchiformes_Based全球扩散生物地理学研究数据
2026年1月26日 30 44 15
数据集概述 本数据集包含合鳃鱼目（Synbranchiformes）鱼类的超保守元件（UCEs）测序数据及系统发育分析结果，用于研究该类群的全球扩散历史与生物地理学模式。数据支持东南亚为主要类群祖先区域的结论，排除冈瓦纳大陆分裂假说，揭示独立大陆入侵事件，共包含十五个文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre）...
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Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据
2026年1月11日 30 148 92
数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体，探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件（UCEs）及形态学数据，分析基因组与形态的进化模式，揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史，包含267个文件，以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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Dryad_Leptonetid蜘蛛系统基因组学与生物地理学研究数据集2021
2026年1月19日 30 37 7
数据集概述 本数据集为Leptonetid科蜘蛛的系统基因组学与生物地理学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）构建的“宽松”和“严格”两种数据矩阵，以及系统发育分析、分子定年、生物地理推断等相关结果文件，共11个文件，支持该科蜘蛛的分类修订、演化历史及分布格局研究。 文件详解 文档类文件 文件名称：READMELedfordetal2021.txt...
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Syngnathiformes_Based_海龙目鱼类超保守元件系统基因组学分析数据
2026年1月18日 30 42 13
数据集概述 本数据集为海龙目鱼类系统基因组学研究数据，基于超保守元件（UCEs）分析海龙目鱼类的快速辐射进化关系。包含序列比对、组装文件、系统发育树、分析输出等7个文件，支持解析海龙目鱼类主要类群的系统发育关系，验证传统长吻类群单系性及基部快速辐射假说。 文件详解 AccessionInfo.txt 文件格式：TXT...
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Cephalotes_Based_新热带区蚂蚁系统发育与地理分布进化研究数据2022
2026年1月18日 30 77 7
数据集概述 本数据集整合超保守元件（UCEs）、化石及生物地理分布数据，探究新热带区多样性龟蚁属（Cephalotes）的系统发育与地理分布进化，分析巴拿马地峡隆起及GAARlandia陆桥对该类群进化的影响，提供龟蚁属系统发育框架及地理分布演变的关键数据支撑。 文件详解 README_PRICE_ETAL_2022_DATA.txt 文件格式：TXT...
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Tringa_semipalmata_Genomic_鹬属半蹼鹬进化历史研究数据
2026年1月15日 30 195 187
数据集概述 本数据集为鹬属半蹼鹬（Tringa semipalmata）的基因组研究数据，用于分析其两个亚种的进化历史与物种分类争议。包含线粒体DNA序列、核DNA超保守元件（UCEs）序列及相关遗传数据，支持亚种分化时间、基因流及选择压力的研究，共1个压缩文件。 文件详解...
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Euglossini_Phylogenomics_兰花蜂物种多样化与颜色表型系统发育基因组学研究数据
2026年1月4日 30 101 47
数据集概述 本数据集为兰花蜂（Eulaema meriana和Eulaema bombiformis物种复合体）的系统发育基因组学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）和线粒体DNA（mtDNA）的测序数据、系统发育分析配置文件及结果文件，用于验证颜色表型是否对应独立进化支系，共20个文件。 文件详解 系统发育分析配置文件 文件名称：eulaema-...
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Hidden_histories_of_gene_flow_Based墨西哥高地鸟类基因组标记数据
2026年1月7日 30 128 13
数据集概述 本数据集包含墨西哥高地鸟类（Aphelocoma jays）基因流研究的基因组标记数据，通过4303个超保守元件（UCEs）和2500个SNP位点，结合系统发育树、聚类算法及基因渐渗检测（如ABBA/BABA测试），揭示物种分化过程中的基因流历史。数据支持对物种形成模式的分析，共包含9个相关分析文件。 文件详解 文档文件（.txt）...
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Pelagiaria_Phylogenomic_Framework_远洋浮游鱼类系统发育数据_2019
2026年1月3日 30 208 124
数据集概述 本数据集为远洋浮游鱼类（Pelagiaria）的系统基因组学研究数据，包含94种Pelagiaria鱼类的超保守DNA元件（UCEs）序列数据，覆盖超七成属级类群。数据用于构建时间校准的系统发育树，揭示该类群的进化关系、起源时间及多样化模式，涉及形态多样性、生态特征与物种分化的关联分析。 文件详解...
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Texella_Harvester_Species_Based_德克萨斯濒危洞穴盲蛛基因组保护研究数据集
2025年12月31日 30 8 6
数据集概述 本数据集为德克萨斯中部洞穴和岩溶生境中两种联邦濒危盲蛛（Texella reyesi和T. reddelli）的保护基因组学研究数据，包含51个T. reyesi样本（来自46个洞穴）、7个T. reddelli样本（来自5个洞穴）及外群物种的超保守元件（UCEs）序列捕获数据，支持系统发育、多物种 coalescent...
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基于UCE技术的墨西哥短吻石龙子_Plestiodon_brevirostris_系统分类学_生物地理学及基因组学研究数据
2025年12月27日 30 7 5
数据集概述 本数据集为Plestiodon brevirostris组石龙子生物地理学系统基因组学研究的原始数据，包含58个样本的3282个超保守元件（UCEs）序列及相关分析文件。数据用于构建时间校准的系统发育树，探究该组石龙子的地理分布历史与墨西哥跨火山带形成的关联，共包含4个文件。 文件详解 README文件...
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新世界鼠耳蝠线粒体与核基因组进化历史冲突数据集
2025年12月24日 30 70 55
数据集概述 该数据集聚焦新世界鼠耳蝠的基因组进化研究，包含37个代表性物种的完整线粒体基因组序列及3648个超保守元件（UCEs）的靶向测序数据，通过多种系统发育方法分析核基因与线粒体基因树的冲突，探索驱动鼠耳蝠独特进化历史的因素。 文件详解...
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红衣主教唐纳雀属系统基因组学测序方法比较数据集
2025年12月23日 30 188 174
数据集概述 本数据集围绕红衣主教唐纳雀属（Piranga）的系统基因组学研究展开，对比了RAD-seq和UCEs两种测序方法在不同分类水平下的系统发育推断效果，包含两种方法的测序数据、物种树分析结果及补充信息，为鸟类系统发育研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件（.zip格式）： uce_raxml.zip：UCE数据的RAxML分析结果文件...
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保守非外显子元件系统发育基因组学标记数据集
2025年12月15日 30 144 29
数据集概述 本数据集围绕保守非外显子元件（CNEEs）这一新型系统发育基因组学标记展开，包含16种鸟类及鳄鱼外类群的约3600-3800个基因座数据，对比分析CNEEs与超保守元件（UCEs）、内含子的进化特性及系统发育应用价值。 文件详解...
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新热带区稻鼠亚科啮齿动物快速辐射内难解析节点的超保守元件补充材料
2025年12月14日 30 95 6
数据集概述 本数据集为新热带区稻鼠亚科啮齿动物系统发育研究的补充材料，聚焦超保守元件（UCEs）在解决快速辐射类群难解析节点的应用，包含测序数据、系统发育树文件、结果表格及图表等。 文件详解 数据文件: ALIGNS-2.zip、ALIGNS.zip、CONCATENATED_ALIGNMENTS.zip: 压缩文件，可能包含不同数据集的序列比对文件...
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骨鳔总目鱼类系统发育基因组学研究数据集
2025年12月8日 30 18 9
数据集概述 本数据集围绕骨鳔总目鱼类的系统发育基因组学研究展开，通过超保守元件（UCEs）分析探讨其目级分类关系，重点验证脂鲤目单系性争议，包含基因序列、系统发育树、分析结果及说明文档等多类型文件。 文件详解 说明文档（.txt格式）：共10个，如taxon-set.txt（分类单元列表）、tip-name-...
