数据集概述
本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本、NGS文库质量控制文档及参考基因组文件，支持基因表达分析流程的复现与验证。
文件详解
- 文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta，文件格式: FASTA，内容: 弓形虫ME49株v65版本参考基因组序列
- 文件名称: NGS_RNA_seq_Library_QC.pdf，文件格式: PDF，内容: NGS RNA测序文库质量控制报告
- 文件名称: 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh，文件格式: Shell脚本（.sh），内容: 用于构建STAR比对索引的脚本
- 文件名称: 2_align_STAR_TgME49_v65.sh，文件格式: Shell脚本（.sh），内容: 使用STAR进行序列比对的脚本
- 文件名称: 3_featureCounts_Subread_TgME49_v65.sh，文件格式: Shell脚本（.sh），内容: 使用featureCounts进行基因计数的脚本
- 文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_utr2exons.gtf，文件格式: GTF，内容: 弓形虫ME49株v65版本基因注释文件（UTR及外显子信息）
适用场景
- 弓形虫基因表达研究: 复现IF1相关弓形虫株的RNAseq分析流程
- 生物信息学方法验证: 验证STAR比对、featureCounts计数等分析步骤的可靠性
- 寄生虫分子生物学研究: 分析IF1基因修饰对弓形虫转录组的影响
- 测序数据分析教学: 作为RNAseq生信分析流程的实践案例
