数据集概述
该数据集围绕“集合体伞形优化（URE）”方法展开，旨在解决分子动力学模拟中柔性蛋白质构象偏好量化的挑战。URE方法通过结合贝叶斯定理与伞形采样技术，优化构象集合参数，适用于与前向KL散度配合使用。数据集包含模拟脚本、分析设置文件及URE方法实现，以丙氨酸-丙氨酸两性离子和奇诺林肽为验证系统，支持相关模拟与分析的复现。
文件详解
- 文件名称: README.txt
- 文件格式: TXT
- 内容说明: 提供复现模拟和数据分析的脚本、设置文件及URE方法参考实现的说明，提及数据分为丙氨酸-丙氨酸两性离子和奇诺林肽（1UAO）两个主要文件夹，重加权脚本位于指定路径。
- 文件名称: Stoeckelmaier2025_URE_Archive.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容说明: 压缩包文件，推测包含数据集的完整内容，如模拟数据、分析脚本等。
适用场景
- 分子动力学模拟优化研究: 用于分析URE方法对构象集合参数优化的效果
- 蛋白质构象分析: 支持柔性蛋白质构象偏好的量化研究
- 贝叶斯方法应用: 探究贝叶斯定理在分子模拟数据处理中的实践
- 计算生物学方法验证: 验证URE方法在不同蛋白质系统中的适用性
