数据集概述
本数据集围绕基因树不一致引发的表观替换率变异现象（SPILS）展开，通过模拟实验与真实数据验证，探讨其对进化分析的影响及解决方案。包含实验结果图表、说明文档和原始数据压缩包，为研究不完全谱系分选（ILS）对分子进化推论的干扰提供支持。
文件详解
该数据集由8个文件组成，具体说明如下：
- 图表文件（PDF格式）:
- sup_fig1.pdf, sup_fig2.pdf, sup_fig3.pdf, sup_fig4.pdf, sup_fig5.pdf, sup_fig6.pdf: 6个补充图表文件，可能展示SPILS效应模拟结果、果蝇数据验证结果等实验可视化内容
- sup_fig_captions.pdf: 补充图表说明文档，解释各图表的内容和意义
- 数据压缩包:
- alignments_trees.tar.gz: 压缩文件，可能包含序列比对文件和基因树/物种树数据，为实验的原始或处理后数据
适用场景
- 分子进化研究: 分析不完全谱系分选（ILS）对替换率变异推论的影响
- 进化生物学方法学: 验证SPILS现象对正选择检测假阳性率的干扰
- 基因组数据分析: 评估基因树不一致对分支长度推断的系统性偏差
- 计算生物学模拟: 复现SPILS效应随ILS水平和类群数量变化的规律
- 进化推论校正: 为解决基因树不一致导致的错误推论（如趋同进化）提供参考依据
