数据集概述
本数据集为Plestiodon brevirostris组石龙子生物地理学系统基因组学研究的原始数据，包含58个样本的3282个超保守元件（UCEs）序列及相关分析文件。数据用于构建时间校准的系统发育树，探究该组石龙子的地理分布历史与墨西哥跨火山带形成的关联，共包含4个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称：README_for_plestiodonUCE.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含数据集的研究背景、实验方法、数据说明及使用指引等文档内容
- 分区文件
- 文件名称：plestiodonUCEpartitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录UCEs序列的分区信息，如不同UCE片段的碱基位置范围（如uce10fasta对应1-480位碱基）
- 系统发育文件（PHY格式）
- 文件名称：plestiodonUCE.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：包含石龙子样本的UCEs序列数据，用于系统发育分析
- 系统发育文件（NEX格式）
- 文件名称：plestiodonUCE.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：以NEXUS格式存储的UCEs序列数据，兼容主流系统发育分析软件
数据来源
论文“A phylogenomic perspective on the biogeography of skinks in the Plestiodon brevirostris group inferred from target enrichment of ultraconserved elements”
适用场景
- 生物地理学研究：分析Plestiodon brevirostris组石龙子的地理分布历史与墨西哥跨火山带形成的关联
- 系统发育分析：利用UCEs序列数据构建时间校准的系统发育树，探究物种间的进化关系
- 基因组多样性研究：通过超保守元件序列分析该组石龙子的基因组多样性及物种分化模式
- 进化生物学研究：验证不同系统发育估计方法（如串联法与多物种溯祖法）对生物地理重建结果的影响
