数据集概述
本数据集包含利什曼原虫维亚尼亚亚属中L. naiffi和L. guyanensis的基因组测序、组装及注释结果,通过与其他维亚尼亚亚属基因组的系统发育和进化比较,揭示该亚属共有的基因组特征及物种特异性结构变化,为利什曼病的分子分型、流行病学监测和临床治疗提供数据支持。
文件详解
- 基因组序列文件:
- Lnaiffi_LnCL223_genome.fa.gz:L. naiffi基因组序列文件,FASTA格式(压缩)
- Lguyanensis_LgCL085_genome.fa.gz:L. guyanensis基因组序列文件,FASTA格式(压缩)
- 染色体与组装注释文件:
- LGCL085-chromosomes-all-13-new.embl.gz:L. guyanensis染色体注释文件,EMBL格式(压缩)
- LNCL223-chromosomes-all-6-new.embl.gz:L. naiffi染色体注释文件,EMBL格式(压缩)
- LGCL085-bin-all-13-new.embl.gz:L. guyanensis基因组组装注释文件,EMBL格式(压缩)
- LNCL223-bin-all-6-new.embl.gz:L. naiffi基因组组装注释文件,EMBL格式(压缩)
- 补充数据文件:
- Lnaiffi-Lguyanensis-SupplTables-141217.xlsx:补充表格文件,Excel格式
- Lnaiffi-Lguyanensis-SupplData-141217.docx:补充数据文档,Word格式
- 图表文件:
- Figure-1.pdf:研究相关图表,PDF格式
适用场景
- 利什曼原虫分子分型研究:用于开发基于基因组特征的物种鉴定方法
- 流行病学监测:分析维亚尼亚亚属不同物种的分布及进化关系
- 临床治疗研究:探究毒力因子(如leishmanolysin)与致病性的关联
- 基因组进化分析:研究寄生虫基因组结构变异及基因家族扩张/收缩机制
- 诊断技术优化:基于特异性基因组区域开发更精准的诊断工具