模式生物VPS13蛋白AlphaFold预测结构数据集

数据集概述

本数据集包含多种模式生物VPS13蛋白的AlphaFold预测结构。因蛋白较大，仅对部分序列进行预测，并通过PyMOL对齐结构，同时提供域组织摘要PDF文件，为研究VPS13蛋白结构提供数据支持。

文件详解

• 蛋白结构压缩文件（共22个，格式为.zip）：
• 示例文件：Celegans_T08G11.zip、Athaliana_At4g17140.zip等
• 内容：包含每个蛋白序列的最佳预测结果（.pdb文件）及PyMOL组装的完整结构（.pse文件）
• 域组织摘要文件：
• 文件名称：VPS13 domain organization across eukaryotic evolution.pdf
• 文件格式：PDF
• 内容：以域卡通图形式展示所有上传结构的汇总信息

适用场景

• 分子生物学研究：分析不同模式生物VPS13蛋白的结构特征与进化关系
• 结构生物学研究：基于AlphaFold预测结果探究VPS13蛋白的功能域组成
• 计算生物学应用：验证AlphaFold在大型蛋白结构预测中的准确性
• 生物信息学分析：通过PyMOL对预测结构进行可视化与比较分析