数据集概述
本数据集围绕新世界山雀（Aves: Poecile）物种树推断展开，探究采样设计对系统发育关系准确性的影响，包括所需基因座数量、基因座属性（简约信息性、变异性等）的作用。使用40个核基因座和线粒体DNA，通过四种基于溯祖的物种树推断方法分析，支持黑顶山雀与卡罗莱纳山雀的姐妹群关系，为近缘类群的系统发育研究提供参考。
文件详解
- Harrisetal_supplemental.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩归档文件，推测包含研究相关的补充材料，具体内容需解压后查看
- Harrisetal_sequencefile.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：序列文件，通常包含核苷酸或氨基酸序列数据，用于系统发育分析的基因序列信息
数据来源
论文“The influence sampling design on species tree inference: a new relationship for the New World chickadees (Aves: Poecile)”
适用场景
- 物种系统发育关系研究: 用于分析新世界山雀物种间的系统发育关系，验证不同基因座和方法对结果的影响
- 采样设计优化: 探究基因座数量、属性对物种树推断准确性的作用，为相关研究的采样方案设计提供参考
- 基因流分析: 基于核基因与线粒体基因树的冲突信号，研究物种间的基因流水平及对系统发育的影响
- 近缘类群参数估计: 分析不同基因座数量对种群参数（如分化时间、有效种群大小）估计准确性的影响
