数据集概述
本数据集围绕磷酸二酯酶6（PDE6）基因展开，包含其在脊椎动物中的进化分析、比较同线性分析及斑马鱼中的基因表达数据，涉及催化亚基与抑制亚基基因家族的扩张、新成员鉴定及昼夜表达振荡特征等内容，共21个相关文件。
文件详解
- 系统发育分析文件（.phb格式）
- 示例文件：PDE6_catalytic-PhyML、pde6_supplementary_birds_reptiles_phyml_tree.phb等
- 共9个文件，占比42.86%，记录基因家族的系统发育树结果
- 序列文件（.fst、.fa、.fasta格式）
- 示例文件：DPYS_20141201.fst、Supplementary_file_1.fa、PDE6_supplementary_Birds_reptiles.fasta等
- 共10个文件（.fst8个、.fa1个、.fasta1个），占比约42.86%，包含基因序列信息
- 补充表格文件（.xlsx格式）
- 文件名称：Supplementary file 2 - location all gene families.xlsx
- 1个文件，占比4.76%，记录所有基因家族的位置信息
- 无扩展名文件
- 1个文件，占比4.76%，具体内容未明确
数据来源
论文“Evolution and expression of the phosphodiesterase 6 genes unveils vertebrate novelty to control photosensitivity”
适用场景
- 分子进化研究：分析PDE6基因家族在脊椎动物中的扩张机制及进化关系
- 基因表达调控分析：探究斑马鱼PDE6抑制亚基基因的昼夜表达振荡特征
- 脊椎动物感光适应研究：研究PDE6基因对不同光强适应的特殊化功能
- 基因家族比较分析：通过同线性分析了解PDE6催化与抑制亚基基因家族的起源与分化
