Pisum_sativum_Transcriptomic_atlas_豌豆转录组图谱数据

数据集概述

本数据集整合了来自7项国际研究的149个公开RNA-seq文库,覆盖10个豌豆品种的81种生物条件(包括植物器官、非生物胁迫、生物互作等)。数据基于豌豆参考基因组重新组装,计算生物重复的平均表达值,包含44756个基因的表达信息,为豌豆转录组研究提供全面参考。

文件详解

  • 文件名称:Transcriptomic_atlas_100625.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含豌豆基因组44756个基因在81种生物条件下的表达数据,数据经STAR比对、FeatureCounts计数及DESeq2中位数比率标准化处理,覆盖植物器官、非生物胁迫(矿质营养、水分、温度)和生物互作(根瘤)等场景。

数据来源

7项国际公开研究(详见atlas_info)

适用场景

  • 豌豆基因表达模式研究: 分析不同品种、器官及生物/非生物胁迫下的基因表达特征。
  • 植物抗逆机制分析: 探究豌豆响应矿质营养、水分、温度胁迫的转录组调控网络。
  • 生物互作分子机制研究: 解析豌豆根瘤相关的基因表达变化,揭示共生互作机制。
  • 植物分子育种: 为豌豆功能基因挖掘及分子标记开发提供转录组数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 25.55 MiB
最后更新 2026年1月18日
创建于 2026年1月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。