数据集概述
本数据集包含Pyrenophora teres hybrid WAC10721的基因组注释、蛋白质功能预测、与参考基因组的直系同源基因分析,以及重复序列、分泌蛋白、效应子和次生代谢物等相关数据,共4个文件,支持真菌基因组学研究。
文件详解
- 文件名称:Orthologous analysis of P teres hybrid_WAC10721_Poudel et al 2020.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Pyrenophora teres hybrid WAC10721与两种P. teres参考基因组的直系同源基因分析结果
- 文件名称:Function prediction of annotated protein of P. teres hybrid WAC10721_Poudel et al 2020.gff3
- 文件格式:GFF3
- 字段映射介绍:记录注释蛋白质的功能预测信息
- 文件名称:Repeats secretomes and effectors of P. teres hybrid WAC10721_Poudel et al 2020.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因组中的重复序列、分泌组和效应子相关数据
- 文件名称:Gene annotation of P. teres hybrid WAC10721.gff3
- 文件格式:GFF3
- 字段映射介绍:提供Pyrenophora teres hybrid WAC10721的基因注释信息
数据来源
论文“Draft genome assembly of Fusarium pilosicola, Meredithiella fracta, Niebla homalea, Pyrenophora teres hybrid WAC10721, and Teratosphaeria viscida”(IMA Fungus 12, 30 (2021))
适用场景
- 真菌基因组注释研究:分析Pyrenophora teres hybrid WAC10721的基因结构与功能注释
- 蛋白质组学分析:基于蛋白质功能预测数据开展真菌蛋白质功能研究
- 比较基因组学研究:利用直系同源基因分析结果,探究该杂交菌株与参考基因组的进化关系
- 真菌效应子与致病性研究:通过分泌蛋白、效应子数据,研究真菌与宿主的互作机制