数据集概述
本数据集为RAD测序技术在深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定中的应用研究数据,包含12个候选物种的系统发育关系分析结果,对比了Stacks和PyRAD两种分析流程,验证线粒体标记的物种界定假设,揭示物种内遗传结构与地理分布的关联,共含2个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_Pante_etal_Heredity_2014_DRYAD.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含研究标题、作者、期刊、研究状态、研究类群(Chrysogorgia属)及数据集内容说明,提及压缩包内包含3个子文件夹的研究数据。
- 文件名称:Pante_etal_Heredity_2014_DRYAD.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,内含3个子文件夹,存储RAD测序原始或处理后数据,具体内容需解压后查看。
数据来源
论文“Use of RAD sequencing for delimiting species”(Heredity期刊)
适用场景
- 基因组学物种界定研究:利用RAD测序数据验证深海八放珊瑚物种的遗传边界,对比线粒体标记与基因组数据的一致性。
- 海洋生物系统发育分析:基于RAD loci构建Chrysogorgia属物种的系统发育树,解析物种间进化关系。
- 遗传结构与地理分布关联研究:分析物种内遗传分化与地理距离的相关性,识别隐存种或种群结构。
- 测序技术应用评估:对比Stacks与PyRAD两种RAD分析流程的性能,优化非模式生物基因组数据处理方案。