人参皂苷G_Rg1的C_20葡萄糖基分子模拟数据集

数据集概述

本数据集包含针对人参皂苷G-Rg1的C-20葡萄糖基的分子对接与分子动力学模拟数据，围绕野生型及工程化DUase β-葡萄糖苷酶与底物的结合动态及构象变化展开，覆盖50纳秒模拟过程的关键时间点数据。

文件详解

• 文件名称：Simulation files-C20.zip
• 文件格式：ZIP压缩包（.zip）
• 压缩包内包含两个主文件夹：
• Docking Structure：含分子对接的PDB格式坐标文件，来自计算建模与数据库源
• MD Structure：含50纳秒生产运行关键时间点（0ns、10ns、20ns、30ns、40ns、50ns）的PDB格式坐标文件，覆盖野生型酶+G-Rg1底物（C20）、DUase突变体+G-Rg1底物（C20）两个模拟系统

适用场景

• 酶工程研究：分析β-葡萄糖苷酶野生型与突变体的催化定位差异
• 分子动力学研究：探究人参皂苷G-Rg1的C-20葡萄糖基在酶-底物复合物中的构象变化
• 药物开发：为基于人参皂苷F1的生物合成工艺优化提供分子机制数据支持
• 结构生物学：验证酶工程改造对底物结合动态的影响