数据集概述
本数据集提供人源formin结合蛋白21（h-FBP21）串联WW结构域与天然结合伴侣SmB/B'核心剪接蛋白中富含脯氨酸序列形成的两种模拟复杂结构，包含平行和反平行结合取向及不同WW结构域相对定位。
文件详解
该数据集包含10个文件，具体说明如下：
- 说明文档:
- README: 无格式文件，提供数据集文件的详细说明。
- 结构文件 (.pdb格式):
- 6.pdb、14.pdb: 两种结合取向的代表性结构文件。
- 6_for_VMD.pdb、14_for_VMD.pdb: 适用于VMD软件的结构文件。
- 轨迹文件 (.xtc格式):
- 6_rep5_skip-1000.xtc、14_rep5_skip-1000.xtc: 分子动力学模拟轨迹文件。
- 可视化与分析文件:
- 6.pdf、14.pdf: 两种复合物结构的图像文件。
- 210913_V-1324.vmd: VMD软件的可视化脚本文件。
适用场景
- 结构生物学研究: 分析h-FBP21串联WW结构域与配体的结合模式及结构动态变化。
- 分子动力学模拟: 研究蛋白质结构域间柔性 linker 对结合取向的影响。
- 计算生物学分析: 构建蛋白质-配体相互作用模型，预测结合亲和力。
- 生物信息学教学: 作为分子结构可视化与模拟分析的教学案例数据。
