Salamanders_MHC_Based_蝾螈MHC_I基因进化原始数据

数据集概述

本数据集包含30种蝾螈(涵盖有尾目6科16属)的MHC-I基因外显子2和3的原始序列数据,记录了约3000种序列变体及2-22个基因拷贝/物种的结构多样性,支持分析免疫基因进化轨迹、正选择位点及重组机制,为脊椎动物MHC多样性研究提供基础数据。

文件详解

  • README_MHC-I_sequences_RAW_DATA.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:说明数据集包含的16属有尾目两栖动物(如Ambystoma、Andrias、Batrachoseps等)的MHC-I外显子2和3序列信息,标注数据类型为原始数据
  • MHC-I_sequences_RAW_DATA.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内存储蝾螈MHC-I基因外显子2和3的原始序列数据,对应16属蝾螈的免疫基因序列变体及拷贝数信息

数据来源

论文“Salamanders reveal novel trajectories of amphibian MHC evolution”

适用场景

  • 脊椎动物免疫基因进化研究:分析MHC-I序列多样性、基因拷贝数变异及进化轨迹
  • 正选择位点分析:验证MHC-I肽结合域正选择信号及与人类肽结合位点的结构同源性
  • 重组机制研究:探究MHC-I基因的外显子内重组事件对多样性的贡献
  • 生物信息学分析:作为原始序列数据支撑非模式生物免疫基因组学的序列比对、基因型分析等下游研究
  • 两栖动物适应性进化研究:结合生活史性状分析MHC-I基因扩张/收缩的驱动机制
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.09 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。