SARS_CoV_2刺突蛋白成药性探索的监督分子动力学数据集

数据集概述

该数据集包含针对SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(RBD)与ACE2结合抑制的分子动力学模拟数据,涉及2421种已批准小分子的虚拟筛选及后续验证,重点分析了头孢磺啶等候选药物对RBD-ACE2结合的影响,为抗病毒药物研发提供动态分子作用依据。

文件详解

  • 分子动力学轨迹文件(.xtc格式):共13个,记录蛋白质-小分子复合物的动态变化过程,如Cromoglycate_post-docking_MD_500ns.xtc、RBD-cefsulodin_binding_to_ACE2_replica_2.xtc等
  • 蛋白质结构文件(.pdb格式):共10个,包含分子对接或结合后的三维结构,如Cromoglycate_post-docking.pdb、RBD_ACE2.pdb、RBD-cefsulodin_binding_to_ACE2.pdb等
  • 压缩文件(.zip格式):1个systems_4_MD.zip,可能包含批量分子动力学模拟相关数据

适用场景

  • 抗病毒药物研发:分析小分子对SARS-CoV-2刺突蛋白RBD的结合作用及对RBD-ACE2相互作用的影响
  • 分子动力学研究:探究蛋白质-配体复合物的动态构象变化
  • 虚拟药物筛选验证:辅助评估候选药物的成药性及作用机制
  • 结构生物学分析:研究刺突蛋白RBD与ACE2结合的动态过程及小分子干预效果
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 930.81 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。