数据集概述
本数据集包含针对TCR阻断型HLA-A11:01特异性人单克隆抗体（1H5 mAb）与HLA-A11:01分子对接实验的输入文件与输出结果，涵盖分子结构、对接参数、预测数据等多类型文件，为相关分子相互作用研究提供数据支持。
文件详解
- 分子结构文件（.pdb格式，共3个）：
- 6id4_chainAB_singleunit.pdb：可能为HLA-A*11:01或抗体相关的基础分子结构文件
- 1h5fv_forMD.pdb：用于分子动力学模拟的1H5抗体片段结构文件
- 1h5fv_MDpredicted.pdb：分子动力学模拟预测得到的抗体片段结构文件
- 实验输入文档（.docx格式，1个）：
- 20240531_1h5fv_MDinputs.docx：记录分子动力学模拟的输入参数与实验设置
- 预测数据文件（.csv格式，1个）：
- 20240531_1h5fv_Paragraph_predictedparatope.csv：包含抗体互补决定区（CDR）预测结果，字段涵盖pdb编号、链类型、氨基酸信息、原子坐标及预测值等
- 分子对接输出压缩包（.zip格式，1个）：
- HADDOCK_1h5fv_Dockingoutput.zip：存储HADDOCK软件生成的分子对接结果文件
- 约束条件文件（.txt格式，1个）：
- 1h5fvCDRrestraints.txt：记录分子对接过程中CDR区域的空间约束参数，包含残基位置与距离限制等信息
适用场景
- 免疫学研究：分析TCR阻断型抗体与HLA分子的相互作用机制
- 结构生物学研究：探究抗体互补决定区（CDR）的空间结构与功能关系
- 药物研发：为单克隆抗体药物的分子设计与优化提供结构数据支持
- 计算生物学：用于验证分子对接与动力学模拟算法的准确性
