数据集概述
本数据集为热带东太平洋（TEP）Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据，整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息，用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限，结果支持二者为同一物种。
文件详解
- 文件名称：Nobia-maf02_SNPS.vcf，格式：VCF
- 字段映射介绍：包含单核苷酸多态性（SNPs）数据，用于基因组水平的遗传分化分析
- 文件名称：pc1_all.asc、pc2_all.asc，格式：ASC
- 字段映射介绍：主成分分析（PCA）结果文件，记录样本在第一、第二主成分上的得分，反映遗传结构
- 文件名称：COI_alignment.nex，格式：NEX
- 字段映射介绍：线粒体细胞色素c氧化酶亚基I（COI）基因的序列比对文件，用于物种鉴定与系统发育分析
- 文件名称：locality_points.xlsx，格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本采集地点信息，包含地理坐标等，用于生态位比较与地理分布分析
- 文件名称：70_percent_for_RAxML.phylip，格式：PHYLIP
- 字段映射介绍：用于RAxML软件分析的基因序列文件，包含约70%的保守位点数据，支持系统发育树构建
数据来源
论文“Genomic, ecological, and morphological approaches to investigating species limits: a case study in modern taxonomy from Tropical Eastern Pacific surgeonfishes”
适用场景
- 鱼类物种界定研究：通过多维度数据验证表型差异是否对应物种分化
- 基因组遗传分化分析：利用SNPs与主成分分析结果，研究种群遗传结构与基因流
- 线粒体DNA条形码应用：基于COI基因序列进行物种鉴定与亲缘关系分析
- 生态位分化研究：结合地理坐标数据，分析物种生态位的相似性与分化程度
- 系统发育树构建：使用保守位点数据，重建刺尾鱼的进化历史与分类地位
