数据集概述
本数据集基于蕨类植物转录组测序数据,开展核基因组范围内的分子进化速率变异研究,聚焦生态多样性丰富的凤尾蕨科(Pteridaceae),包含12个物种2091个基因座的表达序列数据,分析维特arioid蕨类与其他类群的进化速率差异及驱动机制,为蕨类分子进化研究提供数据支撑。
文件详解
- README_for_Additional_file_10.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:描述Grusz & Schuettpelz从ProteinOrtho输出中获取同源正交群的方法,包括2499个覆盖13个类群的正交群筛选、序列提取及输出文件说明
- Additional_file_10.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含研究中使用的转录组衍生正交群序列数据,具体内容需解压后查看
数据来源
论文“Transcriptome sequencing reveals genome-wide variation in molecular evolutionary rate among ferns”
适用场景
- 蕨类植物分子进化研究:分析凤尾蕨科不同类群核基因组的分子进化速率差异
- 转录组数据应用:探索非模式植物转录组在进化生物学研究中的应用价值
- 进化机制分析:研究维特arioid蕨类进化速率加快的驱动因素及选择压力
- 基因组学数据整合:为蕨类植物核基因组与质体基因组进化速率的比较研究提供数据支持