数据集概述
本数据集包含蛙类系统发育基因组学研究相关数据，涉及95个核基因的88-kb分子数据及20个化石校准点，构建了主要蛙类支系的系统发育树并提供进化时间尺度。数据揭示了三个主要冈瓦纳蛙类支系在白垩纪-古近纪边界的快速同时多样化，以及蛙类的祖先分布区域和演化关系。
文件详解
- 基因树文件包
- 文件名称：gene_trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基因树相关数据的压缩包，具体内容未提供预览
- 系统发育树文件
- 文件名称：RAxML_309sp.tre、RAxML_164sp.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于RAxML构建的309种和164种蛙类的系统发育树
- 时间树文件
- 文件名称：Chronogram_309sp.tre、Chronogram_164sp.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：包含309种和164种蛙类的时间校准系统发育树（时间树）
- 分子数据集文件
- 文件名称：309sp_95_genes_88386_2N_20170615.nexus、164sp_95_genes_88302_2N_20170615.nexus
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：分别包含309种和164种蛙类的95个核基因分子数据，数据长度分别为88386和88302字符
数据来源
论文“Phylogenomics reveals rapid, simultaneous diversification of three major clades of Gondwanan frogs at the Cretaceous–Paleogene boundary”
适用场景
- 蛙类系统发育研究: 利用系统发育树和时间树分析蛙类主要支系的演化关系和分化时间
- 生物多样性演化分析: 研究白垩纪-古近纪边界对蛙类多样性爆发的影响机制
- 生物地理学研究: 分析蛙类的祖先分布区域及地理演化历史
- 进化生物学研究: 探讨大灭绝事件后生态机会对物种辐射演化的作用
- 分子系统学方法验证: 评估大规模分子数据在解决深层系统发育关系中的应用价值
