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Gene_ontology_Term_Enrichment_生猪饲喂实验肌肉组织分析数据
数据集概述 本数据集为生猪饲喂实验相关的基因本体(Gene ontology)术语富集分析结果,记录了饲喂苦味混合物(咖啡因、葡萄和龙胆提取物组合)的猪腰最长肌中显著上调(FDR < 0.05)的基因本体术语信息,仅包含1个文件。 文件详解 文件名称:Additional file 1 - GO terms and DAP of pork...
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Wellcome_Open_Research_布氏锥虫蛋白质组低复杂度区域识别基础数据2020
数据集概述 本数据集是布氏锥虫蛋白质组低复杂度区域(LCRs)识别的基础数据,包含6个补充文件,涉及InterPro结构域与LCR的位置信息、基因本体富集分析、序列特性分析、翻译后修饰(PTMs)分布及信号肽与LCR的重叠情况等内容,为布氏锥虫蛋白质组功能研究提供结构化参考。 文件详解 Supplement File 2.xlsx 文件格式:XLSX...
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基于Pdamicornis_Cgoreaui和Dmelanogaster的交响乐团功能聚类结果数据
数据集概述 本数据集是PHILHARMONIC方法在三种生物(造礁珊瑚P. damicornis、共生藻C. goreaui、果蝇D. melanogaster)中的应用结果,包含24个文件,涉及功能聚类、基因本体映射、序列信息等内容,用于揭示非模式生物的功能关系与组织架构。 文件详解 功能聚类与网络文件...
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Variational_Autoencoders_Based乳腺癌DNA甲基化深度学习分析补充数据
数据集概述 本数据集为论文“基于变分自动编码器的无监督深度学习框架在乳腺癌全基因组DNA甲基化分析与生物特征提取中的应用”的补充数据,包含二十二个CSV文件和一个DOCX文件,记录了DNA甲基化分析相关的基因本体(GO)术语、统计指标等信息,可用于乳腺癌表观遗传学特征研究。 文件详解 数据文件(CSV格式,共二十二个)...
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Supplementary_Tables_Based_肾脏缺血再灌注损伤细胞状态与可变剪接动力学数据
数据集概述 本数据集为肾脏缺血再灌注损伤(IRI)相关研究的补充表格集合,包含基因表达计数、主题建模结果、细胞亚型标记基因列表、基因本体(GO)富集分析结果及可变剪接外显子信息等10个表格,覆盖肾脏IRI后的细胞状态变化与分子调控机制相关数据。 文件详解 Table S1 - Counts matrix.Ver-3.xlsx 文件格式:XLSX...
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snRNA_seq第5步处理差异表达分析结果_基于Wilson等人2025年论文代码的测试示例数据集
数据集概述 本数据集是Wilson et al.2025研究中“snrnaseq-step5-process-dea-results”代码的测试用示例数据,用于验证单细胞核RNA测序(snRNA-seq)差异表达分析(DEA)结果的处理流程,包括识别k折交叉验证的差异表达基因(DEGs)及DEG亚群。 文件详解...
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Genome_wide_association_studies_Source_共生扩展表型遗传结构分析数据
数据集概述 本数据集基于根瘤菌-苜蓿共生系统的全基因组关联研究(GWAS),探索共生扩展表型的遗传结构。通过191株根瘤菌与两种苜蓿基因型在不同环境下的配对实验,识别出环境依赖型、宿主依赖型及通用型三类调控宿主适合度的根瘤菌基因座,为构建可靠的基因型-表型(G→P)图谱提供数据支持。 文件详解 关联分析结果文件(Excel格式)...
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Alternaria_alternata_bZIP_Based_链格孢菌转录因子胁迫响应与致病机制研究数据
数据集概述 本数据集围绕链格孢菌(Alternaria alternata)中bZIP转录因子展开,包含该真菌的基因组序列、基因注释及代谢通路分析文件,覆盖基因功能、KEGG通路、GO注释等信息,为研究其在胁迫响应与致病过程中的作用提供基础数据支撑。 文件详解 基因组序列文件...
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biomedRxiv平台上的_McCann和Sammons研究团队关于p63β转录活性研究的补充表格_数据
数据集概述 本数据集为McCann AA和Sammons MA关于ΔNp63β转录活性的研究论文补充表格,包含表1至表5,涉及ΔNp63β亚型特异性C端编码的差异转录活性相关数据,支持论文核心研究结论,共5个Excel文件。 文件详解 文件列表(共5个.xlsx格式文件): TableS1.xlsx:论文补充表1,具体内容未提供预览...
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Network_Pharmacology_Based_桂枝_芍药药对治疗慢性疼痛合并焦虑抑郁靶点机制预测数据
数据集概述 本数据集通过网络药理学方法,分析桂枝-芍药药对治疗慢性疼痛合并焦虑、抑郁的潜在靶点及作用机制。包含15种活性成分、130个潜在靶点,筛选出9个关键靶点,涉及11条核心通路,为该中药复方的作用机制研究提供数据支持。 文件详解 靶点相关文件...
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陆地棉双向最佳比对与OMA同源基因比较数据集
数据集概述 本数据集为论文“Homoeolog inference methods requiring bidirectional best hits or synteny miss many pairs”的配套数据,包含陆地棉(Gossypium...
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加州红鲍转录组测序SNP发现与高分辨率熔解分析数据集
数据集概述 本数据集为加州红鲍转录组测序研究成果,包含通过cDNA焦磷酸测序鉴定的622个高质量SNP标记,及45个具基因本体功能信息的SNP标记,其中8个在个体中呈多态性,通过高分辨率熔解分析(HRMA)验证,为评估遗传多样性提供候选基因数据。 文件详解 Hr summary report.pdf:PDF格式,红鲍SNP研究的总结报告文档 Multi...
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波西多尼亚海草克隆整合分子特征数据集
数据集概述 本数据集记录了波西多尼亚海草在慢性光照不足条件下,不同类型分株(顶端与垂直)的分子整合特征。通过控制光照实验,探究转录组、DNA甲基化、光生理等多尺度响应,验证垂直分株为顶端分株提供资源的假设。 文件详解 文件名称: Supporting_Information_Ruocco_et_al._REV1.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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束带蛇转录组_焦磷酸测序_从头组装及性别特异性差异数据集
数据集概述 本数据集包含西部 terrestrial 束带蛇(Thamnophis elegans)的转录组数据,通过焦磷酸测序技术生成,涵盖雌雄性别特异性转录本差异。数据经从头组装得到基因序列,结合注释分析识别性别特异性基因、SNPs、INDELs及进化相关基因,为爬行动物分子资源研究提供支持。 文件详解...
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新型正交CRISPR_Cas9可编程转录激活因子的植物基因激活数据集
数据集概述 本数据集为新型正交CRISPR/Cas9可编程转录激活因子相关研究的支撑数据,包含实验方法、图表、表格等材料,聚焦植物基因激活的全基因组特异性分析,为相关生物学研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件(共10个PDF格式文件): METHODS.pdf:实验方法详细说明文档 Figure S1 gRNA design and...
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蚕豆分子育种基因SSR引物数据库数据集
数据集概述 本数据集围绕蚕豆分子育种需求,构建了基因SSR引物数据库,包含引物设计信息、PCR实验数据及基因注释结果,为蚕豆遗传多样性分析与分子标记辅助育种提供支撑。 文件详解 文件名称:Designed_SSR_primers_information(SUPPLEMTERY 1 (PRIMERS-WITH-ANNOTATION)_.xlsx...
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藻类_胚胎植物氧化信号收敛研究的加权基因共表达网络分析补充信息
数据集概述 本数据集为“藻类-胚胎植物氧化信号收敛研究”的补充信息,围绕加权基因共表达网络分析(WGNCA)展开,按两种藻类(Zygnema、Mesotaenium)和一种苔藓植物(Physcomitrium)三个物种分类呈现分析结果。 文件详解 数据集包含36个文件,按物种分类,具体如下: - 藻类(Zygnema...
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三刺鱼淡水湖泊殖民化基因表达可塑性数据集
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼从海洋入侵淡水湖泊后,基因表达可塑性在新环境适应中的作用展开。通过对比海洋祖先种群与淡水衍生种群在7°C和22°C极端温度下的基因表达差异,分析了超14000个基因的可塑性,发现淡水种群具有更多可塑性表达基因,为环境适应的分子机制研究提供数据支持。 文件详解 数据文件:...
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现代人类生殖基因中的古老适应性基因渗入数据集
数据集概述 本数据集聚焦现代人类生殖基因中来自尼安德特人或丹尼索瓦人的古老适应性基因渗入现象,包含基因渗入检测、正选择分析结果,以及高分辨率图片和补充表格,为研究古老基因渗入对现代人类生殖基因的影响提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型文件,具体说明如下: - 核心分析文件: -...
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KPPepGen_Based_生物信息学实验数据完整数据
数据集概述 该数据集为KPPepGen研究提供预处理的GO/菌株知识数据和肽序列数据,用于支持相关生物信息学分析。 文件详解 文件名称: source data.zip 文件格式: ZIP压缩包 (.zip) 内容说明: 包含KPPepGen研究中使用的预处理GO/菌株知识数据和肽序列数据,具体字段映射信息需解压后查看原始文件获取 适用场景...



