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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据
数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件(UCE)诱饵集,包含36个半翅目样本(覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属)及1个缨翅目外群的UCE数据,同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果,可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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Rosa_Supplementary_Material_玫瑰基因组代谢物分析补充数据
数据集概述 本数据集为论文《The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses》的补充材料,包含通过GC-MS技术对6个玫瑰品种、3种植物部位进行的靶向代谢物分析数据,支持玫瑰基因组研究及驯化机制分析。 文件详解 文件名称:Supplementary...
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Birkbeck_Thesis_Supplemental_Tables_结核分枝杆菌研究数据
数据集概述 本数据集是伦敦大学伯克贝克学院博士论文的补充表格数据,围绕结核分枝杆菌复合体的宿主特异性及非编码RNA的作用展开,采用基因组和转录组学方法研究。包含12个Excel格式的补充表格文件,为论文研究提供结构化支撑数据。 文件详解...
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线虫反义转录进化研究数据_Pristionchus_pacificus_2016年
数据集概述 本数据集基于线虫Pristionchus pacificus的链特异性RNA-seq文库测序结果,包含1112个反义转录结构配置信息,核心为465个嵌入宿主基因内含子的反义转录本(ASTs)。同时涵盖20种线虫基因组反义基因对的进化分析数据,涉及vps-4、ddx-27等保守基因座的结构变化研究。 文件详解...
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Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据
数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制,通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异,识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路,包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征,为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称:33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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snakes_phylogenomics_Based_蛇类科间系统发育基因组关系研究数据
数据集概述 本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据,包含3776个核基因座的超保守元件序列,涉及29种蛇类(覆盖几乎所有科),是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系,揭示了3个新分支,为脊椎动物系统发育研究提供支撑。 文件详解 序列文件(.phy格式)...
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CBGP_Inrae_Source_蚜虫线粒体核共生体基因组系统发育研究补充数据_2024
数据集概述 本数据集为论文“蚜虫系统发育中线粒体、核与共生体基因组的不一致性:谁在说真话?”的补充数据,包含补充表格、补充图表、实验方案文档及4个存档文件,覆盖蚜虫样本信息、基因扩增数据、基因组矩阵、系统发育树及共生菌基因组草案等内容,支持蚜虫系统发育的多组学分析。 文件详解 补充表格文件 文件名称:Supplementary_Tables.xlsx...
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IStraw90_Strawberry_Based_佛罗里达大学草莓基因组SNP阵列探针数据
数据集概述 本数据集为佛罗里达大学草莓育种项目所用的全基因组IStraw90 SNP阵列探针数据,包含1558个独特草莓个体的9908个SNP标记基因型信息,用于基因组预测模型构建,以优化草莓育种亲本选择,缩短育种周期。数据集仅含一个文件。 文件详解 文件名称:GenoT2468.10.xlsx 文件格式:XLSX...
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Eurycea_spelaea_Based_Ozark高原洞穴蝾螈系统发育基因组数据_2017
数据集概述 本数据集聚焦Ozark高原洞穴蝾螈(Eurycea spelaea...
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Genome_Transcriptome_Based_Calanus物种核插入缺失标记开发数据
数据集概述 本数据集为Calanus属桡足类物种鉴定的核插入缺失标记开发相关数据,基于C. finmarchichus和C. glacialis两个近缘物种的基因组与转录组测序分析,包含12个物种特异性扩增子长度标记的开发成果,可用于Calanus属多个物种及杂交种的分子鉴定,共含5个文件。 文件详解...
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Trissolcus_basalis_Genome_Based寄生蜂基因组补充材料数据2023
数据集概述 本数据集为寄生蜂Trissolcus basalis(膜翅目,缘腹细蜂科)的基因组补充材料,该寄生蜂是研究蝽类害虫生物防治的模式生物。数据源自2023年发表的相关研究论文,包含一个文件,用于支撑该寄生蜂基因组研究的补充信息。 文件详解 文件名称:oo_809128.xlsx 文件格式:XLSX...
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Snake_Phototransduction_Genes_选择压力变化与光感受器转导研究数据
数据集概述 本数据集聚焦蛇类视觉系统进化的分子机制,包含蛇类光转导基因的转录组、基因组及选择压力分析相关数据。通过测序7个蛇眼转录组,结合全基因组和靶向捕获测序数据,分析基因丢失及选择压力变化,为蛇类进化起源、光感受器转导的分子基础提供支撑。 文件详解 Transcriptome Assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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Cyanistes_caeruleus_Based_蓝山雀基因组转录组多态性与选择信号研究数据
数据集概述 本数据集为蓝山雀(Cyanistes caeruleus)的基因组与转录组特征研究数据,包含参考基因组组装、雌雄转录组映射、全基因组变异鉴定及性别差异表达分析结果,涉及性腺、脑等组织,可用于探究自然选择与性选择的遗传基础,共8个文件。 文件详解 选择信号分析文件...
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Perfect_microsatellite_Based_36种爬行动物基因组完美微卫星分布数据
数据集概述 本数据集通过Krait软件识别并定位了36种爬行动物基因组中的完美微卫星DNA序列,核心内容为这些微卫星在基因组内的分布信息,共包含1个压缩文件,可用于爬行动物基因组结构与微卫星特征的相关研究。 文件详解 文件名称:Perfect-microsatellite distribution in the genomes of 36...
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COVID_19_Phylogenetic_Analysis_年龄组死亡风险评估补充数据2020
数据集概述 本数据集为COVID-19各年龄组死亡风险评估研究的配套数据,基于基因组系统发育分析方法,用于支持研究中关于病毒基因组与死亡风险关联性的分析。数据集包含一份压缩格式的补充材料,是理解COVID-19年龄相关死亡风险机制的重要参考。 文件详解 文件名称:Supplementary...
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Proteogenomic_Characterization_胆管癌临床关联蛋白质基因组学研究补充数据
数据集概述 本数据集为胆管癌蛋白质基因组学特征研究的补充表格集合,包含七份Excel文件,内容与胆管癌的蛋白质基因组学整合分析及临床结局关联相关,是该研究的重要补充资料。 文件详解...
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SelectionComponents_Simulation_Based_性选择基因组选择组分分析模拟数据
数据集概述 本数据集为性选择基因组选择组分分析的模拟数据,基于个体模型探究该方法检测选择信号的效用。模拟二倍体有性繁殖种群,引入强配偶选择定量性状模拟性选择,通过加权FST值比较成体与后代基因组等位基因频率,分析选择位点检测效果,包含6个相关文件。 文件详解 代码文件...
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Comparative_Cytogenetics_Based_亚洲沼泽鳗四种重复元素核型特征补充数据_2017
数据集概述 本数据集是论文《亚洲沼泽鳗(Monopterus albus)四种重复元素(18S–28S rRNA基因、端粒序列、微卫星重复基序、Rex逆转录元件)的核型特征与鉴定》的补充材料1,包含1个文档文件,记录了亚洲沼泽鳗染色体相关的重复元素数据,为核型特征研究提供补充支持。 文件详解 文件名称:oo_142011.docx 文件格式:DOCX...
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ZooKeys_Supplementary_Based_冬虫夏草寄主昆虫新种基因组SNP数据_补充材料2019
数据集概述 本数据集是论文《Thitarodes shambalaensis sp. nov.(鳞翅目,蝙蝠蛾科):全基因组SNP数据支持的冬虫夏草新寄主》的补充材料2,包含冬虫夏草新寄主昆虫Thitarodes shambalaensis sp. nov.的全基因组SNP分子数据,为该新物种的鉴定及寄主关系研究提供分子生物学依据。 文件详解...
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