数据集概述
本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件（UCE）诱饵集，包含36个半翅目样本（覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属）及1个缨翅目外群的UCE数据，同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果，可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。
文件详解
- RAxML_alignInput_&_Trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含RAxML分析使用的比对输入文件及生成的系统发育树文件
- UCE_loci.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：半翅目样本的UCE位点数据，涵盖新测序样本及从已发表组学数据中挖掘的位点
- UCE_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：UCE位点的序列比对结果文件
- scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：数据分析所用的脚本文件，支持数据处理与分析流程复现
- phyluce_workflow.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：记录数据分析流程的文本文件，包含Illumiprocessor数据清洗、Phyluce组装、UCE位点查找与提取等步骤的脚本调用说明
- config_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：数据分析流程使用的配置文件
数据来源
论文“Insight from an ultraconserved element bait set designed for hemipteran phylogenetics integrated with genomic resources”
适用场景
- 半翅目系统发育关系解析: 利用UCE数据重建半翅目高阶分类单元的系统发育树，验证关键节点的亲缘关系
- 分子进化研究: 分析UCE位点的保守性与进化速率，探究半翅目物种的分子进化模式
- 种群遗传分析: 基于UCE位点数据开展半翅目物种的种群结构与遗传多样性研究
- 诱饵集适用性评估: 验证UCE诱饵集对不同半翅目类群（含老旧标本）的捕获效率与数据质量
- 组学数据整合应用: 结合已发表基因组/转录组数据，拓展半翅目系统发育研究的样本覆盖度与数据维度
