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ERICA_Based_深度学习历史基因渗入推断数据集
数据集概述 本数据集为深度学习方法ERICA的配套数据，用于推断基因组范围的进化关系和局部基因渗入区域。ERICA可处理群体基因组数据和多基因组组装的序列比对，能高效识别不一致的谱系模式和基因组交换区域，已在Heliconius蝴蝶和水稻的真实数据中验证应用。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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NEMBASE4_Based线虫转录组资源功能注释数据
数据集概述 本数据集为线虫转录组资源NEMBASE4的补充数据，包含六十余种线虫（含寄生与自由生活类群）的EST组装转录本、蛋白序列及功能注释信息，支持线虫转录组比较分析、寄生表型相关基因鉴定等研究，含补充信息压缩包与说明文档。 文件详解 Supplementary_Information.zip 文件格式：ZIP...
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raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集
数据集概述 本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集，包含三十个文件，覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式，涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容，无明确目录结构，可用于生物信息学相关分析。 文件详解 数据文件类 信号强度测量文件：如Fig. S9Dand...
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Takydromus_Based草蜥物种分化历史研究数据
数据集概述 本数据集围绕台湾特有草蜥属（Takydromus）三个单系物种的分化时间与物种形成过程展开研究，包含20个核基因座测序数据及1个GenBank已发表线粒体基因座数据，通过多物种溯祖等贝叶斯方法分析，探讨基因流对分化时间估算的影响，揭示更复杂的物种分化历史。 文件详解 序列文件 文件名称：12S.fas 文件格式：FAS...
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Micrarchus_低温胁迫转录响应与遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕新西兰竹节虫属（Micrarchus）开展，包含高山与低地物种对低温胁迫的转录响应及种群遗传结构数据。通过RNA-Seq、qPCR技术分析低温诱导的差异表达基因，结合线粒体DNA、核糖体DNA及SNP数据探究种群遗传背景对基因表达的影响，揭示低温适应的分子机制与种群分化特征。 文件详解 转录组注释文件...
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Blair_Based鼠狐猴姐妹物种多基因座溯祖分析数据
数据集概述 本数据集包含用于分析鼠狐猴姐妹物种（Microcebus murinus与M. griseorufus）种群历史及物种形成模式的多基因座DNA序列数据。通过溯祖方法检验异域物种形成与边缘成种假说，涉及遗传多样性、有效种群大小及谱系分选等分析内容，为脊椎动物进化驱动力研究提供支撑。 文件详解 Blair_alignments.zip...
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Lamium_Based_植物DNA条形码适用性评估数据
数据集概述 本数据集围绕Lamium属（唇形科）植物的DNA条形码适用性评估展开，测试了11个单基因座（包括9个叶绿体基因、ITS核区及线粒体nad5基因内含子）和7个多基因座组合的鉴定效果，筛选出最优单基因座和基因座组合，为植物物种鉴定提供参考。 文件详解 文件名称：Alignments.zip 文件格式：ZIP...
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热应激响应实验_水生无脊椎动物物种复合体热耐受性差异数据
数据集概述 本数据集围绕萼花臂尾轮虫（Brachionus calyciflorus）物种复合体开展，通过47个克隆的nuITS1和mtCOI标记鉴定进化支系（B. calyciflorus sensu stricto和B....
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Lemmus_Based_挪威旅鼠古DNA进化历史研究数据
数据集概述 本数据集为研究挪威旅鼠（Lemmus lemmus）起源的古DNA分析数据，包含17个文件，涵盖BEAST输入文件、MrBayes输入文件、进化树注释结果、序列比对数据集等，用于探究该物种在晚更新世至全新世的进化历史及冰期避难所生存证据。 文件详解 BEAST分析文件...
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ssRNAP_Based噬菌体单链RNA聚合酶启动子数据集
数据集概述 本数据集聚焦噬菌体单链RNA聚合酶（ssRNAP）启动子相关信息，包含一个Excel格式文件，为研究噬菌体基因表达调控、启动子结构与功能提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：噬菌体ssRNAP启动子.xlsx 文件格式：XLSX...
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Dryad_Data_欧洲地松鼠多基因座系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集基于欧洲地松鼠（EGS）的多基因座系统地理学研究，包含线粒体DNA序列（细胞色素b基因）和12个核微卫星标记的分析数据，覆盖其现有自然分布区的915个样本。数据揭示了该物种的进化与古地理历史，支持潘诺尼亚和东南巴尔干草原作为更新世间冰期大陆气候的隐秘避难所，反映其冰期扩张/间冰期收缩的动态模式。 文件详解 README文件...
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软体动物_5S_rDNA基因家族_转录调控区与进化分析数据
数据集概述 本数据集为软体动物5S rDNA基因家族研究的补充数据，涵盖双壳类、腹足类和头足类等物种的5S rDNA序列分析结果，重点研究贻贝科物种的转录调控区保守性、二级结构预测及长期进化模式，识别出不同类型的非转录间隔区及假基因拷贝，支持软体动物5S rDNA基因家族的进化机制研究。 文件详解 文件名称：README_for_Sequence...
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Rhinella_蟾蜍群_系统发育关系_分子生物学研究数据
数据集概述 本数据集聚焦南美及巴拿马分布的Rhinella granulosa蟾蜍群（共13种）的系统发育关系研究，采用5个核基因与4个线粒体基因（单样本最长7910bp）进行分析，揭示了该类群的单系性、核与线粒体序列的拓扑不一致性及杂交渐渗事件，是两栖动物分类学与进化研究的重要分子数据支撑。 文件详解 文件名称：alignments.zip...
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RNA_virome_Based海洋病毒进化起源研究支持数据
数据集概述 本数据集为论文“Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome”的支持数据，包含海洋RNA病毒的系统发育树、序列比对文件、分类列表及映射文件等，用于分析全球海洋RNA病毒的分类修订、进化起源及生物地理分布，共8个文件。...
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Dryad_Source_果蝇螺旋体共生菌适应性表型研究数据
数据集概述 本数据集围绕果蝇及其共生菌螺旋体的宏进化持久性展开，通过转染实验测试不同螺旋体菌株在新宿主中的传播能力及表型表达，包括杀雄、寄生蜂抗性、线虫抗性等适应性特征，共包含7个文件，用于研究共生菌的宿主定植、传播机制及表型演化。 文件详解 数据文件（.xlsx格式，共5个） QPCRDryad.xlsx：包含qPCR实验相关数据...
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DNA_Barcoding_Salep用兰花物种鉴定研究数据
数据集概述 本数据集为Salep用块茎兰科植物的DNA条形码鉴定研究数据，包含490条nrITS、trnL-F间隔区和matK序列（涉及133个类群），用于鉴定伊朗12个城市购买的31批次150个块茎样本的物种多样性，以评估贸易对兰花野生种群的影响。 文件详解 Sequence alignment files.zip 文件格式：ZIP...
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House_crow_Based生物入侵遗传驱动因素研究数据
数据集概述 本数据集围绕家鸦（Corvus splendens）这一生态广适性鸟类的成功入侵潜力展开，通过研究其遗传结构揭示快速扩张的分子机制。包含13个大陆本土种群与1个岛屿本土种群的遗传数据，以及5个引入种群的对比分析，覆盖核基因内含子与线粒体基因组，为生物入侵的遗传基础研究提供支持。 文件详解 系统发育分析输入文件...
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Proteaceae_Based进化辐射气候性状互作研究数据
数据集概述 本数据集为南半球Proteaceae科植物进化辐射研究相关数据，包含系统发育树、序列比对及补充表格三类文件。通过构建337种Proteaceae植物的系统发育树，结合261种植物的叶片功能性状与1645种植物的气候生态位数据，验证性状与气候互作驱动开放生境中进化辐射的假说，支持分析植物进化路径与多样化速率的关系。 文件详解...
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Dataset_manuscript_生物基因数据集手稿数据
数据集概述 本数据集包含生物基因相关的手稿数据，涵盖基因序列比对、系统发育树及原始数据等内容。共8个文件，涉及FASTA、TRE、XLSX、GENEIOUS四种格式，主要用于生物信息学领域的基因数据处理与分析。 文件详解...
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Siler_菲律宾特有细趾虎隐存多样性与种群遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集为菲律宾特有森林专性细趾虎的隐存多样性与种群遗传结构研究数据，包含系统发育分析文件、序列比对文件及样本凭证信息表，支持解析该珍稀类群的进化谱系与物种界定，为保护优先序评估提供基础。 文件详解 Siler.etal_BayesianConsensus.tre 文件格式：.tre...
