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Dryad_Based_紫海胆温度胁迫下基因表达响应遗传分析数据
数据集概述 本数据集围绕紫海胆（Strongylocentrotus purpuratus）在温度胁迫下的基因表达遗传机制展开，包含RNA-seq基因表达数据、基因网络定量遗传分析结果及相关分析脚本，用于探究气候变化对物种基因表达遗传变异的影响，共含2个文件。 文件详解 README_for_Runcie_et_al_Dryad.R...
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T1D_Based_1型糖尿病风险基因介导β细胞存活研究辅助数据
数据集概述 本数据集为1型糖尿病（T1D）风险基因介导β细胞在促炎细胞因子刺激下存活机制研究的辅助数据，整合功能基因组学与人类遗传学方法，包含细胞因子响应性顺式调控元件、染色质互作、CRISPR筛选及SNP-SELEX等实验结果，共20个文件，支撑T1D风险相关基因及调控机制的研究。 文件详解 调控元件与染色质互作类...
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RNA_seq_Based_转录组组装与差异表达量化策略评估数据
数据集概述 本数据集为RNA-seq实验转录组组装与差异表达量化的模拟评估数据，包含16个文件，涵盖脚本、代码及压缩包。用于探究转录组特征、技术处理及生物信息学流程对转录组质量和差异表达推断的影响，为RNA-seq实验设计与分析提供方法学参考。 文件详解 代码脚本文件...
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CRC_RNA_seq_Based_韩国队列结直肠癌转录组分析数据
数据集概述 本数据集为韩国队列结直肠癌（CRC）的RNA-seq综合分析结果，包含214名参与者的381份样本（169份正常组织、212份肿瘤组织）的基因表达数据。识别出19,575个表达基因及3,830个差异表达基因，涉及细胞周期、代谢通路等功能注释，还结合临床信息与CMS亚型分析，为CRC分子机制研究提供参考，共含11个文件。 文件详解...
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Dryad_Based象海豹内皮细胞缺氧抗氧化与血管生成信号研究数据
数据集概述 本数据集为象海豹内皮细胞缺氧响应研究的配套数据，包含RNA-seq分析结果、基因列表及配置文件。通过对比象海豹与人类内皮细胞在缺氧条件下的分子差异，揭示象海豹抗氧化系统上调及血管生成信号解偶联的独特机制，为理解海洋哺乳动物缺氧耐受提供分子层面支持。 文件详解 文档类文件...
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nf_core_rnaseq_Based_RNA_seq计数表测试数据
数据集概述 本数据集是基于GSE40419肺腺癌研究数据，通过nf-core/rnaseq流程生成的RNA-seq计数表示例，用于下游RNA-seq分析测试。包含22个文件，涵盖基因和转录本水平的表达结果、合并后的计数与TPM值文件、元数据及质控报告等，支持基因表达分析相关工具的测试验证。 文件详解 单样本结果文件...
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myoblast_0h_APF_果蝇腿盘成肌细胞RNAseq表达数据
数据集概述 本数据集包含果蝇腿盘成肌细胞在0小时APF（变态发育期关键时间点）的批量RNA测序数据，通过单个Excel文件呈现基因表达相关信息，为研究果蝇肌肉发育早期的基因表达特征提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：GFPvsInputmyoblasts new.xlsx 文件格式：XLSX...
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Shaping_development_慈鲷鱼机械应变转录组研究数据
数据集概述 本数据集聚焦东非慈鲷鱼Astatoreochromis alluaudi的饮食诱导表型可塑性，通过转录组分析揭示机械应变塑造发育的分子基础。包含几何形态测量、qRT-PCR、RNA-seq转录本及线性形态测量四类数据，共4个文件，用于研究慈鲷鱼咽颌表型对硬/软饮食的适应性变化及转录调控机制。 文件详解 几何形态测量数据...
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rna_seq_0hr_08092019_Based_Volcano样本0小时转录组测序数据
数据集概述 本数据集为Volcano样本在0小时时间点的RNA-seq转录组测序数据，包含1个文件，无目录层级结构，未区分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据类型，文件格式统一为.xlsx。 文件详解 文件名称：RNA-seq data for Volcano_0h.xlsx 文件格式：XLSX...
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PRJNA1167900_Source_SARS_CoV_2感染对干细胞损伤早期晚期后果研究数据
数据集概述 本数据集聚焦SARS-CoV-2感染对干细胞损伤的早期及晚期后果研究，涉及病毒通过SP-ACE2或SP-TLR4相互作用损伤造血/内皮谱系干细胞的机制，包括Nlrp3炎性小体过度激活、细胞焦亡等影响。包含3个Excel文件及相关RNAseq数据库信息，用于支持该研究假设的验证与分析。 文件详解 RNAseq数据库关联信息...
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ICB_Riaz_RNAseq_Processed_处理后RNA测序数据
数据集概述 本数据集为ICB_Riaz数据对象的处理后RNA测序数据，通过指定流程处理生成，包含三个压缩文件。数据可用于生物信息学相关分析，支持对基因表达等信息的研究。 文件详解 压缩文件（Archive files） 文件名称：Riaz_kallisto2.zip、Riaz_kallisto1.zip、Riaz_kallisto3.zip...
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Anolis_sagrei_Source_蜥蜴性二态性与基因表达研究数据
数据集概述 本数据集围绕棕安乐蜥（Anolis sagrei）性二态性的进化机制展开，包含其生长发育、基因表达及睾酮处理实验相关数据。通过父系半同胞育种设计，探究体型二态性形成过程中性别间遗传相关性的变化，以及肝脏转录组中性别偏向基因表达的动态，为理解性二态性的生理与遗传机制提供支撑。 文件详解 基因表达数据文件...
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Irisin_bone_resorption_RNAseq_dataset
数据集概述 本数据集为研究鸢尾素（Irisin）直接刺激破骨细胞生成和骨吸收机制的RNA测序数据，包含体外和体内实验中鸢尾素作用下破骨细胞的基因表达差异信息，涉及破骨细胞分化标志物、骨吸收相关基因及成骨细胞刺激因子（clastokines）的表达变化，支持肌肉-骨骼互作及骨重塑调控的研究。 文件详解...
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补充表格_人口水平的转座子表达动力学对真菌作物病原体性状演化研究数据的影响
数据集概述 本数据集为论文“Population-level transposable element expression dynamics influence trait evolution in a fungal crop...
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MacoNPV_A_Based_甜菜夜蛾幼虫肠道病毒感染同步化基因表达数据
数据集概述 本数据集围绕甜菜夜蛾幼虫肠道内MacoNPV-A杆状病毒的体内感染同步化展开，通过数字液滴PCR和RNA-seq技术分析个体幼虫的病毒基因表达，解决体内感染缺乏同步性的问题，识别早期感染基因表达谱，为病毒-宿主相互作用研究提供支持。 文件详解 RNA-seq_data.xlsx 文件格式：XLSX...
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Arbacia_lixula_Based_地中海海胆组织转录组与基因表达数据
数据集概述 本数据集为地中海生态关键物种Arbacia lixula的转录组与基因表达数据，包含体组织（体腔细胞、消化组织）和生殖组织（卵巢、睾丸）的转录组测序结果，以及从头组装的参考转录组和差异表达分析结果，共186084条转录本，可用于研究该物种的组织特异性基因表达及进化适应机制。 文件详解 Arbacia...
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Dryad_Based_FOXA2基因敲除小鼠子宫腺体与胎儿胎盘发育研究数据
数据集概述 本数据集来自FOXA2基因调控子宫腺体功能的研究，通过条件性敲除小鼠模型，分析FOXA2缺失对子宫蜕膜化、胎盘和胎儿发育的影响，包括妊娠不同天数的转录组变化及性别差异，共包含两个数据文件。 文件详解 文件名称：Dryad_mice_gestation_day_17.5_placenta_RNA-seq.csv 文件格式：CSV...
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DFMO_Based_尤文肉瘤PDX模型多胺耗竭诱导铁死亡RNA_seq数据
数据集概述 本数据集包含DFMO处理与未处理的尤文肉瘤PDX模型的RNA-seq数据，用于研究多胺耗竭通过诱导铁死亡抑制肿瘤转移的机制。数据经Salmon比对至人鼠联合参考转录组，主要分析保留人类基因比对结果，包含元数据文件与量化表达谱压缩包。 文件详解 meta_tab.csv 文件格式：CSV...
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Gypsophila_paniculata_美国满天星入侵种群转录组分析数据集
数据集概述 本数据集聚焦美国密歇根州和华盛顿州的入侵物种满天星（Gypsophila paniculata）种群，通过RNA-seq技术分析其分子过程对不同环境的响应机制。内容涵盖转录组表达谱、SNP变异、表型数据（如萌发率）及相关分析脚本，旨在揭示该物种入侵成功的分子可塑性与遗传分化因素，共包含11个文件。 文件详解 数据文件...
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Dryad_Cardamine_多倍体与二倍体祖先生态位分化及同源基因表达数据
数据集概述 本数据集为多倍体植物生态位分化研究的实证数据，包含异源四倍体弯曲碎米荠（Cardamine flexuosa）及其二倍体祖先种（C. amara和C. hirsuta）的栖息地环境数据与基因表达模式数据，用于分析多倍体与祖先种的生态位分化及同源基因表达对生态适应的作用。 文件详解...
