找到45个数据集

标签: TRE格式

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  • Anostomoides_Polyphyly_Based鱼类系统发育分析数据与脚本

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集包含用于分析Anostomidae科鱼类系统发育的整合分子与形态学数据及分析脚本,核心验证Anostomoides属的多系性,并揭示一个演化历史约3700万年的古老属。数据集含8个文件,覆盖数据、脚本、文档等类型,支持系统发育关系重建与分类学研究。 文件详解 文档文件 文件名称:Readme.rtf 文件格式:RTF...
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  • FMDV_SAT1_SAT2_Based东非口蹄疫病毒系统地理与跨物种传播动态研究数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集聚焦东非地区SAT1和SAT2型口蹄疫病毒(FMDV)的进化流行病学,分析1975-2016年病毒在牛与野生非洲水牛间的跨物种传播动态。通过贝叶斯系统动力学模型解析VP1基因片段,推断病毒祖先位置、传播路线及宿主来源,为非洲口蹄疫防控提供科学依据,包含9个相关分析文件。 文件详解 SAT1相关文件...
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  • Notosuchia_K_Pg_Crisis_陆生鳄形超目灭绝生存因素系统发育研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集围绕陆生Notosuchia(鳄形超目分支)在白垩纪-古近纪(K-Pg)灭绝事件中的差异生存展开,包含系统发育结构、体型、古温度、食性等相关分析数据。旨在通过小尺度系统发育研究,揭示该类群生存概率的影响因素,解释Sebecidae科独存的原因,共含17份文件。 文件详解 数据文件(共12个CSV格式) 示例文件:1.Rwd-...
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  • Errazurizia_Phylogeny_Based豆科植物系统发育与新属描述研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为Errazurizia属(豆科)系统发育研究及新单型属Pictarena描述的支撑数据,包含cpDNA和nrDNA分子数据的系统发育树文件、补充文档及说明文件,共七个文件,用于支持分类学研究与新属命名。 文件详解 说明文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Automated_Integration_Based_硬骨鱼类成对鳍丢失宏观进化研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为硬骨鱼类成对鳍丢失宏观进化研究的自动化整合数据,包含12582个物种的胸鳍和腹鳍有无特征数据。通过整合Phenoscape知识库的表型数据与Open Tree of Life的系统发育树,结合本体推理和系统发育传播方法填补缺失数据,最终记录胸鳍独立丢失至少19次、腹鳍48次及部分类群的鳍重新获得现象,共16个相关文件。 文件详解...
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  • Salix_Populus_Based_Salicaceae系统发育组学研究补充数据_2023

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为Salicaceae科中Salix(柳属)和Populus(杨属)及其近缘类群的系统发育组学研究补充材料,包含基于787个基因区域构建的系统发育树、基因序列捕获数据、杂交事件分析结果及多样化速率变化证据,用于揭示导致系统发育冲突的古老杂交模式与差异化多样化机制,共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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  • Ophiocordyceps_Brazil_Minas_Gerais僵尸蚂蚁真菌新谱系系统发育数据

    2026年1月7日   

    数据集概述 本数据集包含巴西米纳斯吉拉斯州发现的Ophiocordyceps属僵尸蚂蚁真菌新谱系的系统发育分析相关数据,对应发表于FUSE期刊的研究论文。数据涵盖多基因序列比对文件、系统发育树文件及说明文档,支持该新谱系的分类学与系统发育研究。 文件详解 多基因序列比对文件 文件名称:Final...
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  • Salamanders_Arboreality_Macroevolution_蝾螈树栖性宏观进化研究数据

    2025年12月31日   

    数据集概述 本数据集为蝾螈树栖性宏观进化研究相关数据,包含蝾螈物种的形态测量、足形态地标、系统发育树、微生境分类等信息,支持分析蝾螈树栖性的进化模式、形态特征与微生境的关联,共含7个文件。 文件详解 数据文件(CSV格式) 文件名称:LinMeas.SpeciesSummaries.csv...
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  • Data_Extinction_Snake_Diversity_Origins_Research_Data

    2025年12月30日   

    数据集概述 本数据集支撑蛇类多样性起源研究,聚焦蛇类现存支系多样性差异、演化模式及灭绝影响。基于覆盖所有科和亚科的系统发育树,分析物种形成/灭绝背景速率、Colubroidea超科辐射机制、演化速率偏差及化石记录反映的灭绝对现存多样性的作用,为理解蛇类多样性动态提供数据基础。 文件详解 蛇类演化数据文件(XML格式)...
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  • 微型禾亚科_Micrairoideae_基于禾本科_Poaceae_Eriachneae族叶绿体基因组系统发育及C4光合作用进化研究原始数据集

    2025年12月27日   

    数据集概述 本数据集包含支持Eriachneae族质体基因组系统发育研究及Micrairoideae亚科C4光合作用进化分析的相关数据,涵盖质体基因组序列、系统发育树、物种分布信息及补充文档,共9个文件,用于探究该类群的系统发育关系、光合途径及生境偏好。 文件详解 质体基因组序列文件(.fsa格式)...
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  • 蛾类反蝙蝠超声信号全球系统发育数据集

    2025年12月22日   

    数据集概述 本数据集围绕蛾类反蝙蝠超声信号展开,包含全球蛾类属级数据、系统发育树、声学及适口性实验数据,用于研究超声警告、拟态与干扰行为的演化,为理解蛾类声学防御策略提供支持。 文件详解 说明文档: README.pdf:PDF格式,可能包含数据集整体说明、文件清单及使用指引 系统发育分析文件:...
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  • 丽鱼科鱼类颌骨解耦与营养多样性数据集

    2025年12月22日   

    数据集概述 本数据集围绕丽鱼科鱼类口腔颌与咽颌功能解耦展开,包含系统发育树、测量数据及图表等文件,支持研究颌骨进化独立性、对取食生态的响应及营养多样性促进机制,为理解生物进化与生态适应关系提供数据基础。 文件详解 系统发育树文件:...
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  • 禾本科分子定年与进化速率研究数据集

    2025年12月19日   

    数据集概述 本数据集围绕禾本科植物的分子定年、进化速率及类群年龄展开研究,包含系统发育分析文件、进化树文件及补充图表,探讨多基因组标记与化石校准对分化时间估算的影响,为进化生物学研究提供数据支持。 文件详解 图表文件(PDF格式):共9个,如FigureS1.pdf、FigureS2.pdf等,包含研究相关的补充图表,用于展示分析结果和可视化内容...
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  • 冠群真节肢动物变态发育演化数据集

    2025年12月15日   

    数据集概述 本数据集围绕冠群真节肢动物变态发育的演化展开,通过整合217个化石类群与96个现生类群的形态数据,结合尖端定年法分析,探究蜕皮动物和真节肢动物的祖先是否普遍具备变态发育特征,为寒武纪或更早时期的发育演化研究提供支持。 文件详解 文档文件(PDF格式): Supplementary Data 1.pdf:...
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  • 三叶虫系统发育定年方法对比研究数据集

    2025年12月13日   

    数据集概述 本数据集围绕三叶虫系统发育定年方法展开,对比cal3与其他后验时间标度方法在翼头虫类三叶虫演化分析中的应用。包含定年所需输入数据、分析代码、结果文件等,为研究定年方法对宏观演化结论的影响提供支持。 文件详解 说明文档与配置文件: README.txt:TXT格式,数据集说明文档,介绍文件组成及使用方法 all-...
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  • 油杉寄生属_Arceuthobium_质体基因组与核系统发育数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集包含油杉寄生属(Arceuthobium)的质体基因组与核系统发育研究数据,涉及基因组测序组装结果、系统发育树文件、凭证标本信息表及分析方案文档,为该属系统发育关系、分类学及质体基因组演化研究提供支持。 文件详解 基因组序列文件(FASTA格式):...
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  • 岛屿植物分类群多样化动态与海洋岛屿生物地理学通用动态模型数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕岛屿植物分类群Cyrtandra的多样化动态展开,验证其是否符合海洋岛屿生物地理学通用动态模型(GDM)预测。核心内容包括生物地理分析、扩散方向推断及多样化速率模拟,覆盖东南亚及太平洋岛屿区域,提供多类型分析文件与结果。 文件详解 说明文档与数据描述: README.md:...
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  • 四钩草属分子系统发育与形态分析数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕四钩草属(Tetraglochin)的分子系统发育与形态分析展开,包含核基因(ITS)和叶绿体DNA(trnL-F)序列数据、系统发育树文件、贝叶斯分析日志及系统发育树可视化图片,支持该属单系性验证及新种T. andina的分类研究。 文件详解 序列数据文件: 2-Tetraglochin-...
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  • 基于连续性状数据构建隐存_近期灭绝或假设类群超度量系统发育树数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕一种新方法展开,该方法通过修改最大似然法,利用连续性状数据将隐存、近期灭绝或假设类群纳入现生类群的超度量系统发育树。数据集包含模拟验证及应用案例(如库莱布拉岛巨安乐蜥Anolis roosevelti的系统发育定位)的相关文件,为系统发育研究提供方法与实证支持。 文件详解 代码文件:Revell-etal-2015.dryad-...
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  • 多基因座物种界定方法数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集包含一种基于贝叶斯模型比较和有根三元组的快速可扩展多基因座物种界定方法相关数据,涵盖模拟数据、实证数据(如芽孢杆菌属序列数据)及补充文档,支持该方法的性能评估与应用验证。 文件详解 系统发育树文件: bacillus.clonalframe.consensus.tre: TRE格式,芽孢杆菌属的共识系统发育树文件...
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