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gonorynchiform_Based_鼠鱚目鱼类系统发育与分化时间研究数据
数据集概述 本数据集包含鼠鱚目鱼类系统发育关系与分化时间研究的相关数据，基于九个核基因的DNA序列及已发表的形态学特征矩阵，通过贝叶斯系统发育分析等方法，探究鼠鱚目鱼类的系统发育与分化时间，涉及不同基因树的一致性、类群单系性及分化时间估计等内容。 文件详解 README文件 文件名称：README_for_gonorynchALL.txt...
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BAMM_Supplementary_Data_宏进化混合分析理论性能评估数据
数据集概述 本数据集为BAMM（宏进化混合贝叶斯分析）理论与性能评估的补充数据。BAMM用于估计系统发育树分支的多样化速率参数并推断速率变化位置，数据集聚焦其理论误差与统计问题的验证，包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：supplementary_data.zip 文件格式：ZIP...
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Global_freshwater_fish_extinctions_2025
数据集概述 本数据集包含已宣布灭绝或野外灭绝的淡水鱼类物种信息，涵盖分类学分类、生物地理分布、灭绝相关因素、生态特征和生物属性，支持相关研究论文的发现，共12个文件。 文件详解 数据文件 Dataset_Vardakas et al.xlsx：XLSX格式，包含淡水鱼类灭绝相关数据...
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附录_基底层雁形目鸟类_古近纪早期北美及欧洲基干雁形目鸟类研究附录数据_2023
数据集概述 本数据集为论文《Basal Anseriformes from the Early Paleogene of North America and Europe》的附录数据，包含古近纪晚期至始新世早期北美及欧洲基干雁形目鸟类的系统发育分析相关文件，涉及特征描述、系统发育树、KH检验结果等内容，共五十六个文件，支持该类群的分类学与演化研究。...
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Centrarchidae_Source_鲈科鱼类系统发育与多样化时间尺度研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美淡水鱼类鲈科（Centrarchidae）的系统发育与多样化时间尺度研究，包含16个核基因的DNA序列数据、形态学数据集及化石校准信息，覆盖几乎所有已知及未描述物种，用于解析鲈科鱼类的演化关系与分化时间。 文件详解 基因序列文件（.nex格式，34个）...
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Helicopter_Damselflies_Based_森林巨豆娘趋同进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕森林巨豆娘的趋同进化展开，通过分子超矩阵方法与形态学数据结合，研究非洲热带区与新热带区巨豆娘的系统发育关系，推翻单系性假设，揭示跨大西洋热带趋同进化现象，包含7个相关分析文件。 文件详解 分子矩阵文件 文件名称：Matrix18.phy、Matrix18.nex 文件格式：.phy、.nex...
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Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据
数据集概述 本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果，包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本，可支持物种系统发育与种群遗传学研究，共6个文件。 文件详解 序列比对文件 文件名称：Alignment_for_RAxML.phy 文件格式：PHY...
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Myristicaceae_Based_印度西高止山脉肉豆蔻科水淹生境适应与演化数据
数据集概述 本数据集为研究印度西高止山脉生物多样性热点区域肉豆蔻科树木水淹生境适应、生态位分化及演化提供支持，包含系统发育分析、DNA序列、演化模型等相关数据，可复现论文中所有分析、图表及表格结果，共23个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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Aquatic_insect_Das_Almas_River巴西水生昆虫采集模型与结果数据集
数据集概述 本数据集记录了巴西Das Almas河采集的水生昆虫样本信息，包含原始数据、贝叶斯分析所用数据、R环境模型文件及分析结果，共1个Excel文件，用于水生昆虫多样性及分布的相关研究。 文件详解 文件名称：Data_set.xlsx 文件格式：XLSX...
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Haringtonhippus_NewGenus_更新世北美洲马新属基因组与形态测量研究数据
数据集概述 本数据集包含更新世北美洲NWSL马的线粒体基因组、部分核基因组及形态测量分析数据，支持其单种属分类及新属Haringtonhippus的命名。通过基因组与形态测量结合分析，明确该马类不属于现生马属，为晚更新世灭绝事件研究提供依据，含60个相关分析文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，38个）...
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HCV_RecombinantGenomes_Based丙型肝炎病毒2k_1b谱系系统地理历史数据
数据集概述 本数据集包含丙型肝炎病毒（HCV）基因型1和2重组基因组相关数据，聚焦2k/1b循环重组形式（CRF）的遗传结构与系统地理历史。整合了19个国家109条序列的全编码区比对、重组断点分析结果及贝叶斯系统地理推断文件，揭示其单系起源、重组断点位置及以俄罗斯为祖先来源的传播路径，共含32个文件。 文件详解 序列比对文件（FASTA格式）...
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PhytoKeys_Poa亚属Pseudopoa_DNA序列分析补充数据2018
数据集概述 本数据集是论文《Poa亚属Pseudopoa（含Eremopoa和Lindbergella）的系统发育与分类概要》的补充材料1，包含Poa属5种DNA序列比对及PAUP、贝叶斯分析的参数和统计数据，用于支持植物分类学研究中的系统发育分析。 文件详解 文件名称：oo_242791.xlsx 文件格式：XLSX...
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Nedubini_Based_近北极螽斯系统发育研究基因序列与分析文件_原始数据
数据集概述 本数据集为近北极盾背螽斯（“Tettigoniinae”）系统发育研究的相关文件，包含5个基因区域的序列数据及系统发育分析文件。研究通过贝叶斯和似然法分析，明确近北极Nedubini为螽斯科基部分支，为理解螽斯演化及北美残遗类群分布提供数据支持，共含3个文件。 文件详解 Project33rdBEAST_wfossils copy.xml...
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DRYAD_Plant_Scrophularia_lowei近缘物种形成研究数据
数据集概述 本数据集为Macaronesian特有植物Scrophularia lowei的物种形成研究数据，通过分析其与广布种S. arguta的遗传关系，探究近缘物种形成机制。包含5个S. lowei种群与25个S. arguta种群的核DNA和叶绿体DNA序列数据，以及相关遗传分析结果，支持近期异域物种形成假说。 文件详解...
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Ambrosia_Experimental_Data_植物入侵成功因素实验研究数据
数据集概述 本数据集为实验草地群落中植物入侵成功因素研究的实验数据，通过将入侵植物豚草（Ambrosia artemisiifolia L.）种子播种到369个实验植物群落，分析入侵植物与群落本地物种的系统发育相关性对入侵成功不同维度的影响，为达尔文归化难题提供实验证据。 文件详解 文件名称：Experimental design and...
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Schizopetalae_Based_阿塔卡马沙漠十字花科植物系统发育特有性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦阿塔卡马沙漠十字花科Schizopetalae族，分析系统发育特有性（PE）热点分布。通过对比核DNA与叶绿体DNA的系统发育树差异，以及物种分布模型（SDM）和最小凸多边形（MCP）两种分布范围估计方法，评估其对PE热点定位的影响，为该区域植物保护提供进化历史相关依据。 文件详解 系统发育分析文件（.bps格式，共3个）...
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NANOGrav_PSR_J1909_3744_偏心超大质量双黑洞后验样本数据2023
数据集概述 本数据集包含使用NANOGrav 12.5年PSR J1909--3744脉冲星数据开展的贝叶斯单脉冲星搜索结果，具体为偏心超大质量双黑洞（SMBHBs）产生的纳赫兹引力波的后验样本，支持相关引力波探测分析。 文件详解 GWecc_1psr_search_README.txt 文件格式：TXT...
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Adiantum_vittarioids_Pteridaceae_系统发育关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕铁线蕨属（Adiantum）与带状蕨类（vittarioids）的系统发育关系展开，包含支持铁线蕨属单系性及其与带状蕨类姐妹群关系的分子数据。数据涵盖质体基因序列比对、最大似然分析及贝叶斯分析相关文件，用于验证该类群的进化关系，共包含六个文件。 文件详解 说明文档类（.txt格式，共3个）...
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桉树三叶种_Eucalyptus_tricarpa_基因组扫描_适应干旱环境的数据分析
数据集概述 本数据集基于澳大利亚东南部桉树（Eucalyptus tricarpa）九个种源的基因组扫描研究，通过贝叶斯分析识别出94个潜在适应性标记。这些标记的等位基因频率与原产地气候因子及公共花园功能性状差异强相关，可用于评估基因组层面的干旱适应程度，为辅助迁移或遗传增强提供参考。 文件详解...
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eutherian_mammal_phylogenomics_系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为真兽类哺乳动物系统发育基因组学研究数据，包含37个物种的447个核基因全基因组数据，用于解决真兽类哺乳动物系统发育中的冲突问题。通过串联法与多物种溯祖模型的对比分析，揭示基因树异质性对系统发育重建的影响，明确真兽类系统发育关系及根位置。 文件详解 文件名称：README_for_gene447_final.docx...
