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Fragile_foundations_Based_长期微气候影响下细木质残体与土壤细菌群落演替模式研究数据集
数据集概述 本数据集为论文配套的序列数据与元数据，聚焦长期微气候影响下细木质残体和土壤中细菌群落的演替模式，包含2012年样本的信息表及序列文件，共2个文件，用于支撑相关微生物生态学研究。 文件详解 Sample_info_for_2012_samples.xlsx 文件格式：XLSX...
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Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据
数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...
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位点与谱系异质性下不变量与经典四元组推断数据集
数据集概述 本数据集围绕位点与谱系异质性下的系统发育四元组推断展开，包含相关研究的附录文档、代码说明及数据压缩包，为比较不变量方法与经典系统发育重建方法（如邻接法、最大似然法）的性能提供数据支持。 文件详解 README_for_Erik2.txt:...
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烟草天蛾基因组从头组装数据集
数据集概述 本数据集提供烟草天蛾（Manduca sexta）的新参考基因组JHU_Msex_v1.0，通过现代技术从头组装，提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb，连续性为原版本的约25倍，scaffold N50超14 Mb，注释含25,256个基因，可供公开使用。 文件详解...
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Galaxy平台MaxQuant与Msstats无标记分析训练数据集
数据集概述 该数据集包含用于Galaxy平台上MaxQuant和Msstats分析的输入文件及中间结果，围绕皮肤癌组织样本展开，为相关训练提供数据支持。 文件详解 主文件列表： input_protein_database.fasta：FASTA格式，MaxQuant分析所需的人类蛋白质数据库文件...
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五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集
数据集概述 本数据集提供五桠果（Dillenia turbinata）的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目，是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对，BUSCO完整性达97%，包含36,967个蛋白编码基因模型，为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md，格式:...
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代谢型谷氨酸受体4靶向癌症免疫治疗研究数据集
数据集概述 本数据集围绕代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用展开，包含基因敲除、药物抑制实验及单细胞测序等相关数据，支撑GRM4靶向作为癌症免疫治疗新策略的研究结论。 文件详解 差异表达基因数据文件：...
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平滑黑珊瑚ITS序列单倍型网络分析数据集
数据集概述 本数据集是对平滑黑珊瑚ITS序列的重新分析结果，基于原始研究的色谱图，通过序列组装、杂合子检测与分相、多序列比对及单倍型网络分析，验证了所有样本为同一物种的结论，包含分析过程中的原始数据与结果文件。 文件详解 压缩文件夹：Leiopathes_ITS_chromatograms.zip，ZIP格式，包含作者提供的原始色谱图文件...
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爪哇岛与巴厘岛淡水鱼类DNA条形码研究数据集
数据集概述 本数据集为爪哇岛与巴厘岛内陆鱼类的DNA条形码参考库研究成果，包含159个物种的1046条DNA条形码数据。研究通过对比采样物种与已知物种清单，发现两地采样覆盖率较低（爪哇岛36%、巴厘岛60%），同时观察到DNA条形码间隙，为巽他陆架区域鱼类多样性研究及物种鉴定提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：BOLDTree.nwk...
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挪威云杉低甲基化部分限制性内切酶_HMPR_方法基因组文库数据
数据集概述 本数据集围绕挪威云杉（Picea abies）基因组展开，通过低甲基化部分限制性内切酶（HMPR）方法构建基因组文库，旨在减少重复序列含量。研究对比了HMPR文库与标准鸟枪法文库的基因富集效率及重复DNA去除效果，发现HMPR可显著富集基因区域并降低重复序列比例。 文件详解 该数据集包含两类文件，具体说明如下： -...
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RDP真菌LSU分类训练数据集_DADA2格式_第11版
数据集概述 该数据集是为DADA2工具格式化的RDP真菌LSU分类训练数据（第11版），基于RDP分类器原始训练集和真菌未对齐序列处理生成，包含多种压缩与未压缩格式的训练文件，用于微生物分类学分析。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： - 分类训练文件: - RDP_LSU_fixed_train_set_v2.fa:...
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RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415
数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料，包含经实验验证的植物NLR（核苷酸结合寡聚化结构域样受体）相关序列、注释及分析结果，涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据，为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件，具体说明如下： - 补充表格文件: -...
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热带山地物种快速适应性分化基因组特征数据集
数据集概述 本数据集围绕巴布亚园丁鸟（Amblyornis papuensis）的适应性分化展开，包含基因组、种群遗传对比及补充材料等11个文件，辅助研究其东西部种群约1.18万年前因气候变暖隔离后的进化过程，揭示环境差异驱动的适应性分化机制。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： - 说明文档类： -...
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树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019
数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料，包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等，为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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RNA_Benchmark_Based_RNA基准数据集完整数据
数据集概述 本数据集为RNA相关基准数据，包含预测、CT等关键词相关内容，由六个压缩文件组成，覆盖序列、结构、多序列比对及预测结果等数据类型，为RNA研究提供基础数据支持。 文件详解 压缩文件集（共6个，均为.zip格式）： fasta.zip：可能包含RNA序列相关的FASTA格式文件...
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埃及伊蚊干旱繁殖适应性基因研究补充数据集2023
数据集概述 本数据集为Venkataraman等人关于埃及伊蚊干旱繁殖适应性基因研究的补充数据，包含论文原始数据、补充分析数据及血液喂养装置操作说明。数据覆盖蛋白质组学、转录组学、基因序列比对、气候分析等多维度内容，支持研究干旱环境下埃及伊蚊繁殖相关基因的功能与进化机制。 文件详解 该数据集包含39个文件，主要类型及示例如下： -...
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不同功能群浮游植物类群有机化合物驱动生长数据集
数据集概述 本数据集围绕有机化合物对不同功能群浮游植物生长的驱动作用展开，包含易北河口17株浮游植物（覆盖4个功能群）利用31种有机化合物生长的实验数据，以及菌株测序信息、补充图表等研究材料，为混合营养型浮游植物的普遍存在性研究提供支持。 文件详解 该数据集包含21个文件，按类型分类说明如下： - 说明文档： -...
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加州红鲍转录组测序SNP发现与高分辨率熔解分析数据集
数据集概述 本数据集为加州红鲍转录组测序研究成果，包含通过cDNA焦磷酸测序鉴定的622个高质量SNP标记，及45个具基因本体功能信息的SNP标记，其中8个在个体中呈多态性，通过高分辨率熔解分析（HRMA）验证，为评估遗传多样性提供候选基因数据。 文件详解 Hr summary report.pdf：PDF格式，红鲍SNP研究的总结报告文档 Multi...
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蛾类反蝙蝠超声信号全球系统发育数据集
数据集概述 本数据集围绕蛾类反蝙蝠超声信号展开，包含全球蛾类属级数据、系统发育树、声学及适口性实验数据，用于研究超声警告、拟态与干扰行为的演化，为理解蛾类声学防御策略提供支持。 文件详解 说明文档： README.pdf：PDF格式，可能包含数据集整体说明、文件清单及使用指引 系统发育分析文件：...
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Tau蛋白及其突变体的液_液相分离与液_固相转变倾向预测数据集
数据集概述 该数据集包含人类Tau蛋白（全长及截短突变体）的液-液相分离（LLPS）与液-固相转变（LSPT）倾向的计算分析数据，涵盖蛋白序列、突变扫描、特征评分及可视化结果，为研究Tau蛋白相变特性提供支持。 文件详解 文本与表格文件： README.txt：数据集说明文档，.txt格式...
