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离散形态数据系统发育分析中进化枝支持评估数据集
数据集概述 本数据集围绕离散形态数据的系统发育分析展开，对比简约法与概率方法（贝叶斯推断、最大似然法）在进化枝支持评估中的效果，含相关分析文件及补充图表，为研究方法选择提供数据支持。 文件详解 文档文件： suppFigureS1.pdf：PDF格式，可能为补充图表S1，展示系统发育分析相关结果或方法对比可视化内容...
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哺乳动物多形态钟与全证据端点定年数据集
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物多形态钟与全证据端点定年研究，包含形态特征演化时钟分析、系统发育拓扑推断及分歧时间估计相关数据，涉及单时钟与多时钟模型对比及参数收敛、树结构等结果文件。 文件详解 该数据集包含26个文件，具体说明如下： - 文档类文件: - Description.docx: Word文档，可能为研究项目的详细描述 -...
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红藻Ceramieae族系统发育分析附录5数据集
数据集概述 本数据集为红藻Ceramieae族系统发育分析的附录5，包含不同数据集（LSU、rbc L_LSU_COI-5P联合数据集等）的进化模型选择、最优似然值、树长等关键分析结果，支持系统发育研究的方法学验证与结果复现。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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蜘蛛科林蛛科全证据系统发育分析补充文件包
数据集概述 本数据集为林蛛科（Linyphiidae）全证据系统发育分析的补充文件包，包含基因序列、表型矩阵、系统发育树等核心数据文件，支持Silva-Moreira等人相关研究的复现与扩展分析。 文件详解 该数据集包含69个文件，按类型分类说明如下： -...
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膜翅目早期辐射总证据化石定年法数据集
数据集概述 本数据集围绕膜翅目早期辐射的定年研究，对比节点定年与总证据定年两种方法。包含形态特征数据、分子数据及化石信息，通过贝叶斯分析探究膜翅目冠群起源时间及分化节点，为理解其早期演化提供数据支持。 文件详解 文件名称: Appendix-1_MorphoCharacterDescriptions.pdf，格式: PDF，内容:...
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兽脚类恐龙化石不同尖端定年方法的拓扑结构_分化时间与宏进化推断数据集
数据集概述 该数据集围绕兽脚类恐龙化石的尖端定年分析展开，对比不同尖端定年方法（如BEAST2）与传统后验时间校准方法（如cal3）的结果差异，探究其对系统发育拓扑结构、分化时间及宏进化推断（如体型演化模式）的影响，为古生物学研究提供多方法定年的对比数据支持。 文件详解 该数据集包含23个文件，主要类型及内容如下： - 文档与说明文件: -...
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早期羊膜动物系统发育与副爬行纲及巨蜥科亲缘关系数据集
数据集概述 本数据集围绕早期羊膜动物的系统发育研究展开，包含支持新系统发育假说的形态学数据、分析脚本及说明文档。该假说对传统认知提出挑战，涉及巨蜥科在哺乳类干群中的位置、副爬行纲与双孔亚纲的嵌套关系等关键问题，为理解羊膜动物早期演化提供数据支持。 文件详解 该数据集包含7个文件，具体说明如下： - 数据矩阵文件： -...
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Hyptidinae亚科核基因与插入缺失编码DNA矩阵数据集
数据集概述 本数据集为唇形科Hyptidinae亚科的系统发育研究提供基因序列数据，包含核基因（nrITS、nrETS、waxy）和质体标记（trnL-F等）的测序结果，支持该亚科属级分类修订及系统发育关系分析。 文件详解 文件名称：Readme.txt，文件格式：TXT...
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Holozoa远缘分支p53家族同源物表征补充材料
数据集概述 本数据集为《Holozoa远缘分支p53家族同源物表征》文章的补充材料，包含13个文件，涉及p53家族同源物的结构预测、序列比对、进化分析等结果，支持研究p53家族的古老起源。 文件详解 PDF文件（10个）： 如Supplementary material 08 p-values of all domain hits in non-...
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被子植物系统发育化石花整合数据集
数据集概述 该数据集围绕被子植物系统发育研究，整合化石花的分子与形态学证据，包含24个化石花的系统发育位置分析数据，涵盖1201种现存被子植物的30个花部性状及分子骨架数据，支持多种系统发育分析方法验证。 文件详解 文献与说明文件：...
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新热带区木材降解甲虫帕萨利尼族系统发育数据集
数据集概述 本数据集包含基于分子和形态学数据的新热带区木材降解甲虫（鞘翅目：黑蜣科）帕萨利尼族系统发育分析相关文件，涵盖分析输入矩阵、配置文件、日志及输出结果，为该类群的系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含二十两个系统发育分析相关文件，具体说明如下： - 输入与配置文件： -...
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伪熊蜂基因树估计误差与超保守元件实证研究数据集
数据集概述 本数据集围绕伪熊蜂属（Pseudapis）的基因树估计误差展开实证研究，对比PhyloBayes、MrBayes、IQ-Tree和RAxML四种方法在超保守元件（>800个）分析中的表现，评估其对物种树构建的影响，为基因树估计提供实践指导。 文件详解 文件名称: readme.txt，格式: TXT，内容:...
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鬣蜥类蜥蜴超保守元件与形态学数据联合证据分析数据集
数据集概述 本数据集围绕鬣蜥类蜥蜴的系统发育研究，整合超保守元件（UCE）基因组数据与形态学数据进行联合证据分析。包含多种加权条件下的最大似然法、贝叶斯分析结果及相关图表，探讨不同数据权重对系统发育树的影响，为基因组与形态学数据整合分析提供实证参考。 文件详解 文档与说明文件：...
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千足虫属Nannaria_Chamberlin_1918小物种组修订研究中的表1数据集
数据集概述 本数据集包含一篇关于千足虫属Nannaria小物种组修订研究中的表1内容，记录了MrBayes系统发育分析中使用的分子数据分区信息，包括基因区域、最佳拟合模型及简约信息特征数。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 包含表1数据，字段映射如下： Partition: 分区编号 Gene...
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红藻Ceramieae族系统发育分析附录4数据集
数据集概述 本数据集为红藻Ceramieae族系统发育分析研究的附录4内容，记录了不同分区数据集的选定进化模型、最佳得分及树长，基于BIC准则通过Modelfinder（IQtree）和MrBayes 3.2贝叶斯推断得出，支持系统发育分析的方法学细节。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML（.html） 内容说明:...
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贝叶斯分支长度推断的复合狄利克雷先验稳健性数据集
数据集概述 本数据集包含修改MrBayes 3.1.2程序以纳入复合狄利克雷先验的相关文件，用于解决贝叶斯系统发育推断中分支长度高估问题，并重新分析六个有问题的数据集，验证新先验的稳健性。 文件详解 文件名称: patchMB3.zip：压缩包格式，可能包含修改后的MrBayes程序补丁文件或相关代码文件 文件名称:...
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神秘囊头类甲壳动物系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集包含针对神秘囊头类甲壳动物（Thylacocephalans）在泛甲壳动物（Pancrustacea）内系统发育亲缘关系的分析数据，涵盖带拓扑约束与无约束两种贝叶斯分析结果，支持相关进化关系研究。 文件详解 约束分析压缩包: Constrained...
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树懒系统发育宏进化趋势与历史生物地理数据集
数据集概述 该数据集基于树懒形态数据超矩阵，通过贝叶斯推断、系统发育与形态钟方法分析64种树懒属的演化。核心内容包括不同支系分化时间、多样性、形态差异及生物地理历史，支持常见树懒类群分支分类，提供分子方法无法测定的主要分支分化时间估计。 文件详解 数据矩阵文件： Matrix.nex：NEX格式数据矩阵，包含树懒形态特征超矩阵数据 贝叶斯分析文件：...
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侧口类纤毛虫进化历史重建特征状态分布数据集
数据集概述 本数据集为侧口类纤毛虫进化历史重建研究中的特征状态分布表，记录了不同类群纤毛虫在30个特征上的状态数据，包含缺失值（?）和不适用值（–），用于系统发育分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: 包含Taxon（分类群）、Character states 1–5（特征状态1-5）、Character...
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分子钟校准方法的尖端与节点互补性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕分子钟校准方法展开，探讨节点校准与尖端校准的互补性。研究指出传统节点校准依赖化石约束，而尖端校准将化石物种作为年代节点与现存物种结合，二者结合可提升进化时间尺度的合理性、精确性与准确性。 文件详解 MrBayes_Analyses.NEX:...
