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Calibration_Uncertainty_Based_分子定年校准先验评估研究数据
数据集概述 本数据集围绕分子定年分析中的校准不确定性展开，对比先验评估与后验评估方法的差异，探讨化石证据解释对贝叶斯分歧时间估计的影响。包含8个文件，涉及序列数据、树文件、控制文件及XML配置文件，用于支持分子钟校准质量评估研究。 文件详解 序列数据文件 文件名称：CytB+RAG1+R35-inc-...
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Dryad_Molecular_Ecology_红雀基因表达与表型关联研究数据_2015
数据集概述 本数据集来自Dryad平台，围绕环北极鸣禽红雀的基因表达与表型关联研究展开，包含基因组SNP数据、转录组基因表达矩阵、系统发育分析文件及相关分析脚本，用于探究红雀表型多样性与基因表达的关系，助力进化生物学领域对物种分化机制的研究。 文件详解 基因组与系统发育文件...
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Placental_Mammals_Supplementary_牙齿进化异速生长研究数据
数据集概述 本数据集为胎盘类哺乳动物牙齿进化异速生长研究的补充材料，包含286个物种的上臼齿比例与绝对尺寸分析数据。通过系统发育分析揭示胎盘类动物牙齿分节序列的进化异速生长模式，即后臼齿相对前臼齿随整体尺寸增大而增大的规律，为脊椎动物分节结构生长调控研究提供支持。 文件详解 Online_Appendix_1_Review.docx 文件格式：DOCX...
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Automated_Integration_Based_硬骨鱼类成对鳍丢失宏观进化研究数据
数据集概述 本数据集为硬骨鱼类成对鳍丢失宏观进化研究的自动化整合数据，包含12582个物种的胸鳍和腹鳍有无特征数据。通过整合Phenoscape知识库的表型数据与Open Tree of Life的系统发育树，结合本体推理和系统发育传播方法填补缺失数据，最终记录胸鳍独立丢失至少19次、腹鳍48次及部分类群的鳍重新获得现象，共16个相关文件。 文件详解...
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Rungwecebus_kipunji_Based_非洲濒危猴类基因渐渗生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集围绕非洲濒危猴类Rungwecebus kipunji的基因渐渗生物地理学研究展开，包含支持其分类地位的基因序列及分析文件，涉及线粒体DNA渐渗现象的验证，为该物种作为独立属的分类学争议提供数据支撑。 文件详解 基因序列文件（.nex格式）...
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Ichthyosaurus_New_Species_英格兰萨默塞特早侏罗世鱼龙分类学研究数据
数据集概述 本数据集为英格兰萨默塞特早侏罗世（赫塘期）鱼龙新物种研究相关文件，包含论文附录、补充材料及系统发育分析矩阵。研究识别出两种新鱼龙物种（I. larkini和I. somersetensis），通过形态特征区分并经系统发育分析支持，共含4个文件。 文件详解 Lomax & Massare APPENDIX.docx 文件格式：DOCX...
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Papionini_Mitogenomics_Based_旧世界猴族线粒体基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集为旧世界猴Papionini族线粒体基因组研究相关数据，包含33个Papionini族样本的线粒体基因组序列及分析结果，涉及Macaca、Mandrillus等6个属，旨在解析该族的系统发育关系与分化时间，为灵长类进化研究提供线粒体基因层面的支撑。 文件详解...
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Salix_Populus_Based_Salicaceae系统发育组学研究补充数据_2023
数据集概述 本数据集为Salicaceae科中Salix（柳属）和Populus（杨属）及其近缘类群的系统发育组学研究补充材料，包含基于787个基因区域构建的系统发育树、基因序列捕获数据、杂交事件分析结果及多样化速率变化证据，用于揭示导致系统发育冲突的古老杂交模式与差异化多样化机制，共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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ENA_PRJEB62664_Symphonia_globulifera全基因组组装与注释数据
数据集概述 本数据集包含热带雨林物种Symphonia globulifera的从头组装核基因组、叶绿体基因组及线粒体基因组相关数据，涉及基因组组装、注释、编码序列提取及基因比对结果，可用于研究该物种的种内遗传变异特性，共包含7个文件。 文件详解...
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Euglossini_Phylogenomics_兰花蜂物种多样化与颜色表型系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为兰花蜂（Eulaema meriana和Eulaema bombiformis物种复合体）的系统发育基因组学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）和线粒体DNA（mtDNA）的测序数据、系统发育分析配置文件及结果文件，用于验证颜色表型是否对应独立进化支系，共20个文件。 文件详解 系统发育分析配置文件 文件名称：eulaema-...
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Peculiar_macrophagous_adaptations_俄罗斯早白垩世上新龙科化石研究数据
数据集概述 本数据集包含俄罗斯晚豪特里维期（早白垩世）新发现的上新龙科化石相关研究数据，涉及系统发育分析文件及补充信息文档，支持对该物种独特食性适应特征、系统发育位置及牙齿演化的研究，为理解早白垩世海洋爬行动物生态多样性提供基础。 文件详解 系统发育分析文件（.nex格式） 文件名称：Plios_red_BL.nex、Plios_full_BL.nex...
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New_World_chickadees_Species_Tree_Inference_Data
数据集概述 本数据集围绕新世界山雀（Aves: Poecile）物种树推断展开，探究采样设计对系统发育关系准确性的影响，包括所需基因座数量、基因座属性（简约信息性、变异性等）的作用。使用40个核基因座和线粒体DNA，通过四种基于溯祖的物种树推断方法分析，支持黑顶山雀与卡罗莱纳山雀的姐妹群关系，为近缘类群的系统发育研究提供参考。 文件详解...
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TP53_Proboscidean_Elephant_Genome_Evolution_Data
数据集概述 本数据集围绕大象基因组中肿瘤抑制基因TP53拷贝数扩增展开，探讨其与大象体型增大、DNA损伤应答增强及Peto悖论的关联。包含3个文件，涉及TP53基因序列及相关演化分析数据，为研究大象基因组演化机制提供基础资料。 文件详解 TP53.xml 文件格式：XML...
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Outgroup_Thalattosuchia_Crocodylomorpha系统发育位置研究数据
数据集概述 本数据集围绕鳄形超目系统发育分析展开，聚焦外类群选择对海鳄类（Thalattosuchia）系统发育位置的影响及鳄形目起源问题。通过扩展外类群采样，分析海鳄类与鳄形目的亲缘关系，探讨趋同演化及特征编码歧义对结果的影响，为古生物分类学研究提供数据支持。 文件详解 系统发育矩阵文件（.nex格式） 文件名称：Turner and Buckley...
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Ophiocordyceps_Brazil_Minas_Gerais僵尸蚂蚁真菌新谱系系统发育数据
数据集概述 本数据集包含巴西米纳斯吉拉斯州发现的Ophiocordyceps属僵尸蚂蚁真菌新谱系的系统发育分析相关数据，对应发表于FUSE期刊的研究论文。数据涵盖多基因序列比对文件、系统发育树文件及说明文档，支持该新谱系的分类学与系统发育研究。 文件详解 多基因序列比对文件 文件名称：Final...
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Eucalyptus_behriana_Genetic_Divergence_Study_Data
数据集概述 本数据集围绕澳大利亚东南部半干旱桉树物种Eucalyptus behriana的种群遗传分化展开，包含通过ddRAD-seq技术获得的基因组位点数据、系统发育分析用的序列比对文件、遗传多样性分析文件及补充表格，用于探究该物种分布间断的演化机制及澳大利亚东南部生物地理历史。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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EversonEtAl_JBiogeography2020_Based马达加斯加山地多样性研究数据
数据集概述 本数据集为研究马达加斯加湿润常绿森林中小型哺乳动物和爬行动物的多样性分化模式提供支持。通过分析20种小型哺乳动物和5种爬行动物的线粒体DNA数据，探讨了山地区域对种群分化的促进作用及分化事件的同步性，识别了北部、中部和南部高地作为重要分化区域的共同系统地理模式。 文件详解 数据文件（.nex格式）...
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Costasiella_ocellifera_Based_海洋腹足类种群遗传多样性与繁殖隔离研究数据
数据集概述 本数据集围绕海洋腹足类海蛞蝓Costasiella ocellifera展开，包含其佛罗里达及加勒比海种群的遗传多样性、繁殖隔离相关数据。通过分析不同幼虫形态（浮游型与非浮游型）种群的线粒体及核基因位点，探究扩散能力丧失对种群连通性、遗传多样性及繁殖隔离的影响，支持海洋生物种群遗传学研究。 文件详解 线粒体基因数据文件...
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phylogeography_northwestern_Pacific_边缘海比较系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集围绕西北太平洋边缘海（东海、南海、日本海）的比较系统地理学研究展开，通过文献调研与再分析，探究区域内海洋生物的种群结构、历史动态及跨海域演化过程，为该区域系统地理学研究提供基础数据支撑。 文件详解 数据说明文件 文件名称：Data set information.xlsx 文件格式：XLSX...
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Leucocarbo_chalconotus_Based_新西兰斯图尔特岛鸬鹚生物多样性减少研究数据
数据集概述 本数据集为新西兰特有斯图尔特岛鸬鹚（Leucocarbo chalconotus）的生物多样性研究数据，包含现代与古代DNA分析、放射性碳定年及贝叶斯建模相关文件，用于评估人类抵达对该物种的影响，揭示南岛东南部与最南端种群不同的数量变化历史。 文件详解 分析模型文件（.xml） 文件名称：BEAST 33...
