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QTL_Mapping_Based野生向日葵适应性渐渗与分布扩张候选等位基因数据
数据集概述 本数据集来自野生向日葵适应性渐渗与分布扩张的QTL定位研究,涉及北美野生向日葵Helianthus annuus和H....
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WBPH_2b_RAD_Based_大湄公河次区域迁入中国北方白背飞虱基因测序数据
数据集概述 本数据集通过2b-RAD测序技术,分析了大湄公河次区域(GMS)白背飞虱(WBPH)迁入中国北方的种群遗传结构。包含18个山东站点及6个GMS区域的样本基因数据,揭示了迁入来源、遗传多样性及种群聚类特征,为明确白背飞虱迁移路线及来源提供支撑。 文件详解 基因测序结果文件...
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SNP_Community_Genetics_多物种SNP标记开发成本效益分析数据
数据集概述 本数据集围绕多物种SNP标记开发的成本效益分析展开,记录了通过RAD-Seq技术结合Python管道为40种非模式物种(含植物、无脊椎动物、鱼类、哺乳动物)开发SNP标记的过程,以及18种法属圭亚那鱼类SNP标记的验证结果,包含6个相关文件。 文件详解...
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Mytilus_Genetic_Based北极亚北极贻贝遗传多样性与连通性研究数据
数据集概述 本数据集为北极亚北极地区Mytilus spp.(贻贝)的遗传多样性与连通性研究数据,包含13个采样点534个个体的81个SNP标记分析结果,用于揭示该区域贻贝物种分布及遗传结构,为北极气候变化下海洋物种分布预测提供基线数据。 文件详解 .csv数据文件(共6个)...
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Populus_balsamifera_Based香脂杨基因组多样性与种群结构数据
数据集概述 本数据集为香脂杨(Populus balsamifera)基因组多样性与种群结构研究数据,包含412个SNP标记及11个核基因座的DNA序列数据,覆盖34个种群的474个个体,用于分析冰后期北美的快速扩张对其基因组多样性、种群结构及迁移模式的影响。 文件详解 文件名称:P_balsamifera_ref_SNPs.xlsx...
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PeerJ_16427_Urophora_cardui种群微卫星与SNP标记特征数据
数据集概述 本数据集包含来自PeerJ论文的Urophora cardui种群遗传标记数据,涵盖微卫星位点和SNP标记的特征信息,用于分析该物种近缘种群的遗传多样性与分化情况,支持种群遗传学研究与生物防治应用。 文件详解 微卫星基因型数据文件 文件名称:Uc_microsats_Genepop.txt 文件格式:TXT...
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Oncorhynchus_mykiss_Based_虹鳟鱼谱系与栖息地自然选择标记数据
数据集概述 本数据集包含虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)的基因组SNP标记数据,基于美国西北部及不列颠哥伦比亚省11个溯河洄游与定居种群的805个个体,筛选276个单核苷酸多态性位点,用于分析谱系间及栖息地的自然选择信号,重点关注免疫相关基因(如MHC II类基因)的适应性分化,为鱼类进化与适应性研究提供资源。 文件详解...
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Dryad_WorldWideCattle_家养牛全球血统分化与混合研究数据_2013
数据集概述 本数据集基于1,543头家养牛的43,043个常染色体单核苷酸多态性标记基因型,分析134个家养牛品种的种群结构,识别亚洲瘤牛、欧亚普通牛和非洲普通牛三大类群,揭示杂交模式、地理扩散及血统混合过程,为理解家养牛演化历史提供支撑。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_WorldWideCattleDryad.txt...
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Einkorn_Geographic_Based欧洲驯化二粒小麦地理分化与迁徙研究数据
数据集概述 本数据集通过DArT-seq技术分析136份二粒小麦地方品种、9份野生二粒小麦和3份乌拉尔图小麦的SNP标记,探究驯化二粒小麦向欧洲的传播路径。数据确认野生与驯化二粒小麦的遗传分化,定位驯化起源于土耳其卡拉卡达格山脉,并识别出阿尔卑斯前地区和马格里布/伊比利亚地区两个主要驯化品种群,为新石器时代迁徙路线研究提供支撑。 文件详解...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠(Peromyscus leucopus)的转录组资源,包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果,用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应,共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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基于ICES分区的6a_7b_7c大西洋鲱鱼遗传种群识别基线数据集_2014年至2021年
数据集概述 本数据集为ICES分区6.a、7.b-c大西洋鲱鱼的遗传种群识别基线,包含至少3个种群的遗传标记数据。通过45个SNP标记对2014-2021年3480个产卵基线样本、2003-2004年270个存档样本及1514个非基线样本进行基因分型,构建了自分配准确率超90%的遗传分配模型,解决了非产卵期种群混合难以区分的问题。 文件详解...
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Salmo_salar_Based_大西洋鲑鱼SNP标记基因分型检测与保护管理数据_2016
数据集概述 本数据集为大西洋鲑鱼(Salmo salar)开发的Ion Torrent Ion PGM平台基因分型检测数据,包含217个成功扩增的SNP标记,涉及遗传性别鉴定、中性遗传变异评估、海成熟年龄相关功能变异分析及遗传亚群分配模块,用于监测特诺河鲑鱼长期遗传变化,适用于多种鲑鱼种群研究。 文件详解 文件名称:README_for_Aykanat...
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IStraw90_Strawberry_Based_佛罗里达大学草莓基因组SNP阵列探针数据
数据集概述 本数据集为佛罗里达大学草莓育种项目所用的全基因组IStraw90 SNP阵列探针数据,包含1558个独特草莓个体的9908个SNP标记基因型信息,用于基因组预测模型构建,以优化草莓育种亲本选择,缩短育种周期。数据集仅含一个文件。 文件详解 文件名称:GenoT2468.10.xlsx 文件格式:XLSX...
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SNP_Based_Streblospio_benedicti多毛类海岸种群遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集聚焦多毛类Streblospio benedicti的多型生活史对海岸种群遗传结构的影响,通过84个SNP标记分析美国东西海岸种群的基因流与遗传分化,验证发育型差异对遗传结构的作用,以及西海岸引入种群的起源。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_SNP_list_streblospio.xlsx...
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Ursus_arctos_Y_Chromosome_Based北欧棕熊种群历史与恢复研究数据
数据集概述 本数据集包含北欧棕熊(Ursus arctos)Y染色体单倍型分布研究数据,通过9个Y染色体STR标记和3个Y染色体SNP标记,分析瑞典、挪威、芬兰及俄罗斯西北部443只现存雄性棕熊的36种单倍型,以及挪威南部1780-1920年14个个体的6种单倍型(含4种现存种群未发现的单倍型),为种群历史与恢复研究提供支持。 文件详解...
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Brassica_napus_Pathogen_油菜病原菌生活方式与宿主抗病基因位点研究补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Pathogen lifestyle determines host genetic signature of quantitative disease resistance loci in oilseed rape (Brassica napus)》的补充数据,包含油菜对四种真菌病原菌(Alternaria...
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Atlantic_mackerel_Transcriptome_SNP_SSR_Markers_2015
数据集概述 本数据集来自论文“Discovery and characterization of 80 SNPs and 1,624 SSRs in the transcriptome of Atlantic mackerel (Scomber scombrus,...
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Phaseolus_vulgaris_Based_乌干达西部农户菜豆种子获取与遗传多样性研究数据
数据集概述 本数据集围绕乌干达西部Hoima地区农户群体的普通菜豆(Phaseolus vulgaris)种子获取及早期采用的遗传模式展开研究,通过4955个SNP标记分析1156份种子样本的分子多样性,包括当地农户样本、育种家选育品种及全球种质资源,对比不同采用行为农户的作物群体结构与遗传多样性差异。 文件详解 文件名称:Wilkus et al....
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RAD_sequencing_Zebra_Finch_Genome_留尼汪灰绣眼鸟SNP标记数据
数据集概述 本数据集通过RAD测序技术结合与斑胸草雀基因组比对,为非模式雀形目鸟类留尼汪灰绣眼鸟生成大量SNP标记。研究使用6个混合样本池测序,构建约60万个contigs,其中38.6万个可比对至斑胸草雀基因组,最终获得8万余个可准确定位且分布均匀的SNP标记,展示了该方法在非模式鸟类中高效开发SNP的潜力。 文件详解...
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DRYAD_Matala_et_al_Rock_Creek流域虹鳟与钢头鳟基因流动研究数据2017
数据集概述 本数据集包含对哥伦比亚河Rock Creek流域虹鳟(Oncorhynchus mykiss)与钢头鳟种群基因流动的研究数据。通过192个SNP标记和5年采样,分析流域上下游虹鳟种群的时空遗传结构,探究季节性河床干旱导致的基因流动限制及自然屏障对基因分化的影响,为渔业保护提供遗传依据。 文件详解...



