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Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集
数据集概述 本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)种群基因组特征,包含213份尼罗罗非鱼样本(来自原生及引入区域)和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据,通过RAD测序获得27611个SNP位点,可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。 文件详解 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
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Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据
数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化,包含约9000个SNP位点的分析数据,结合原住民知识,揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化,为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件(2个) 文件名称:Bowles_et_al-...
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Prolactin_Signalling_Mutations_牛催乳素信号通路功能突变数据_原始数据
数据集概述 本数据集包含牛催乳素信号通路功能互作突变相关的基因型和表型数据,涉及毛发与皮肤表型(如hairy和slick性状)的遗传分析。数据涵盖基因型文件、生理表型数据、TaqMan验证结果等,共7个文件,支持牛催乳素信号通路突变与表型关联的研究。 文件详解 基因型与表型数据压缩包 文件名称:gen_phen_data_for_paper.zip...
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Beacon_Training_Material_Beacon_V2教程训练数据
数据集概述 本数据集为Galaxy Training Material中“Working with Beacon V2”教程的训练数据,包含来自1000 Genomes Project和GDC数据库的5个文件,覆盖JSON、XLSX、VCF、TSV格式,用于指导用户学习Beacon V2的构建、数据转换、导入及变体查询技能,支撑教程中的实操练习。...
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Gemsnakes_Based_马达加斯加宝石蛇种群结构与物种形成率研究完整数据
数据集概述 本数据集包含马达加斯加特有宝石蛇(Pseudoxyrhophiidae科)的种群结构与物种形成率研究相关数据,涉及109个物种的遗传、地理及进化分析文件,用于验证种群结构形成率与物种形成率的关联,控制时间和区域相关的灭绝因素,探究微观与宏观进化过程的连续性。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.md、Text_S1.docx...
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WBPH_2b_RAD_Based_大湄公河次区域迁入中国北方白背飞虱基因测序数据
数据集概述 本数据集通过2b-RAD测序技术,分析了大湄公河次区域(GMS)白背飞虱(WBPH)迁入中国北方的种群遗传结构。包含18个山东站点及6个GMS区域的样本基因数据,揭示了迁入来源、遗传多样性及种群聚类特征,为明确白背飞虱迁移路线及来源提供支撑。 文件详解 基因测序结果文件...
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Botrychium_lunaria_转录组数据_早期分支蕨类植物群体结构分析数据
数据集概述 本数据集包含早期分支蕨类植物Botrychium lunaria的转录组相关文件,用于精细解析其群体结构。涵盖CRY2cA序列比对、肽序列、直系同源群序列比对、模型测试及系统发育树构建等7个压缩文件,支持属级系统发育和群体结构研究。 文件详解 File_S1_CRY2_alignment.zip 文件格式:ZIP...
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CNVkit_Based_RD_Connect_GPAP合成数据拷贝数变异检测数据
数据集概述 本数据集是从Zenodo原始BAM文件集合中提取的子集,基于RD-Connect GPAP合成数据进行处理,通过CNVkit检测拷贝数变异,仅保留感兴趣区域。数据集包含72个文件,涵盖.cns、.vcf、.json三种格式,聚焦于基因组拷贝数变异的分析研究。 文件详解 文件类型与分布...
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Quercus_rugosa_Landscape_墨西哥高山栎气候相关遗传变异数据
数据集概述 本数据集围绕墨西哥高山栎(Quercus rugosa)种群的气候适应性遗传变异展开,通过基因分型测序获取17个采样点103个个体的5354个单核苷酸多态性(SNPs)数据,结合梯度森林模型分析遗传变异与气候因子的关联,识别气候适应相关基因位点,为该物种的气候适应研究及保护管理提供数据支持。 文件详解...
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波罗等人基于绿海葵_Anemonia_viridis_共生菌获取遗传数据_补充资料
数据集概述 本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵(Anemonia viridis)共生菌水平获取机制研究的补充数据,包含宿主动物单核苷酸多态性(SNPs)数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格,用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Raeymaekers_NatCommun_2017_三刺与九刺棘鱼适应性分化研究数据
数据集概述 本数据集包含三刺和九刺棘鱼的基因分型及相关研究数据,用于分析两种亲缘关系相近的鱼类在共同生境中沿盐度梯度的中性与适应性分化差异。数据支撑对物种特异性适应能力、表型平行性与基因组非平行适应性的研究,共含3个文件。 文件详解 九刺棘鱼基因分型文件 文件名称:Raeymaekers et al-...
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Dryad_Eucalyptus_microcarpa_气候基因组适应研究数据2017
数据集概述 本数据集基于DArTseq基因组方法,对澳大利亚东南部26个细叶桉种群的4200余个全基因组单核苷酸多态性(SNPs)进行分析,识别出81个与温度、干旱或降水相关的适应性SNPs,涉及所有11条染色体,为研究气候变化下物种适应性潜力提供支撑。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Woods_2016_Brachypodium_distachyon开花时间变异遗传结构补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Brachypodium distachyon开花时间变异的遗传结构》的补充数据,包含RIL群体(F7;Bd21×Bd1-1)的基因型、表型数据、遗传图谱、基因位置文件、QTL分析R脚本及目标基因的VCF文件,支持开花时间遗传机制研究。 文件详解...
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Genome_wide_SNP_Based_Castanea_alabamensis非杂交起源研究数据
数据集概述 本数据集为支持Castanea alabamensis非杂交起源的全基因组序列分型研究数据,包含北美栗属(Castanea)多个类群(含美洲栗、矮栗及亚洲栗属物种)的基因组数据,通过十万余个单核苷酸多态性(SNP)位点分析,验证了Castanea alabamensis的非杂交起源,共包含4个文件。 文件详解 文档文件...
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Schistosoma_japonicum_Based_日本血吸虫尾蚴全基因组扩增与简化基因组测序实验数据
数据集概述 本数据集包含日本血吸虫尾蚴的全基因组扩增及简化基因组测序相关数据,涵盖实验方法验证、基因变异检测及初步群体结构分析结果,可支持血吸虫病监测中的感染源追溯、耐药性监测等研究,共含13个文件。 文件详解 数据文件 文件名称:S4Table.xlsx 文件格式:XLSX...
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Trachycarpus_fortunei_Based_瑞士南部及意大利北部入侵群体遗传标记分析数据
数据集概述 本数据集为论文配套数据,包含入侵棕榈Trachycarpus fortunei在瑞士南部及意大利北部群体的微卫星与SNP标记分析结果,记录了208个样本的基因型数据,用于揭示该物种的随机交配模式和主动殖民过程,是研究其入侵机制的核心遗传信息资源。 文件详解 GBS分析文件 文件名称:variants.vcf.gz 文件格式:VCF.GZ...
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Poso_Oryzias_Based_Wallacean古湖稻田鱼资源分配与选型交配研究数据2021
数据集概述 本数据集为Wallacean古湖Lake Poso中同域分化稻田鱼(Oryzias属)的研究数据,包含基因组SNP、形态坐标、稳定同位素、卵大小及交配实验等6个文件,用于分析资源分配与选型交配的耦合关系,探讨无“魔法性状”下的同域物种形成机制。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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Lesser_Sandeel_Genomic_Data_北海南海小沙丁鱼群体遗传结构研究数据集2019
数据集概述 本数据集为论文“Weak genetic structure despite strong genomic signal in lesser sandeel in the North...
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黑猩猩亚种Pan_troglodytes的基因组纯化及正向选择推断数据_Archive_VCF_Dryad
数据集概述 本数据集基于外显子捕获技术,研究三种现存黑猩猩亚种(中部、东部、西部)的全基因组核苷酸多样性,包含SNVs和indels变异位点信息,以及选择压力相关分析结果,可用于探究黑猩猩亚种的遗传多样性、种群历史及选择作用差异。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_Archive_VCF_Dryad.rtf 文件格式:RTF...
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Sceloporus_occidentalis_Based_西部_fence_蜥蜴种群扩展分化与存续研究数据
数据集概述 本数据集包含支持Davis等2022年研究的全基因组SNP数据、形态学数据及生态学数据,用于分析西部 fence 蜥蜴(Sceloporus occidentalis)在华盛顿普吉特湾北部分布边缘的种群扩展、分化及存续动态。数据覆盖8个文件,含遗传数据、形态测量及生态信息,可复现该研究的种群遗传学分析。 文件详解 文档文件...



