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Laccaria_trichodermophora_Based_热带天空岛外生菌根真菌种群分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕热带天空岛中外生菌根真菌Laccaria trichodermophora的种群分化展开,通过低浓度DNA的基因分型测序(GBS)分析三个热带天空岛的种群基因组数据,支持异域分化假说,揭示其受更新世气候波动影响的种群动态。 文件详解 序列与标记文件 文件名称:Iontorrentlinker.fasta 文件格式:FASTA...
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Howea_palms_sympatric_speciation_gene_expression_data
数据集概述 本数据集围绕豪勋爵岛两种同域分化的Howea棕榈展开,包含转录组统计、样本统计及转录组序列文件,旨在探究基因表达与编码序列进化在生态物种形成中的作用,关联土壤适应性、开花时间等关键生态表型差异。 文件详解 Table_S5 - Transcriptome stats.xlsx 文件格式:XLSX...
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Global_transcriptome_Changes_Based_多年生黑麦草粉红雪霉早期感染转录组数据
数据集概述 本数据集记录多年生黑麦草受粉红雪霉(Microdochium nivale)早期感染时的转录组变化,包含抗病与感病基因型的转录组序列及差异表达基因、GO富集分析结果,用于研究非低温驯化条件下的抗病分子机制,共4个文件。 文件详解 差异基因与GO分析文件...
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Drosophila_Y_to_autosome_reversal_Genomic_changes_data
数据集概述 本数据集记录果蝇伪暗果蝇中Y染色体逆转自染色体后的基因组变化,包括约10-15百万年前祖先Y染色体与点状染色体融合事件的研究数据,涉及基因组组装、基因表达及注释等信息,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:merged_de.gtf 文件格式:GTF...
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Extension_Partial_Gene_Transcripts_Based_昆虫转录组组装与基因延伸数据
数据集概述 本数据集包含果蝇(Drosophila melanogaster)和红壁蜂(Osmia bicornis)的Trinity组装转录组数据,以及基因转录本延伸的相关文件。数据涉及转录组组装细节、部分基因转录本序列、延伸详情和软件评估结果,共6个文件,支持昆虫基因转录本延伸的研究分析。 文件详解 数据文件...
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Olfactory_receptors_Supplementary_Data_喙头蜥嗅觉受体基因组项目补充数据
数据集概述 本数据集是喙头蜥(Sphenodon punctatus)基因组项目的补充数据,包含从其基因组组装中识别出的嗅觉受体基因相关信息,涵盖完整嗅觉受体基因列表、系统发育关系推断所用的比对文件,以及从 scaffolds 中识别出的嗅觉受体基因(含假基因和部分基因)的Excel表格,共三个文件。 文件详解 完整嗅觉受体基因列表...
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番薯属两种牵牛花基因流与分化选择数据集
数据集概述 本数据集围绕番薯属两种姐妹牵牛花(Ipomoea cordatotriloba和I. lacunosa)的基因流、分化选择及渐渗抗性展开研究,通过基因组SNP数据揭示物种形成早期选择与基因流的复杂相互作用,为岛屿分化源于分化选择的理论提供实证支持。 文件详解...
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儿科肺炎克雷伯菌blaNDM_16b携带IncX3质粒首次鉴定数据集
数据集概述 本数据集包含儿科肺炎克雷伯菌中blaNDM-16b携带IncX3质粒的首次鉴定相关数据,涉及临床信息、下一代测序数据及基因序列文件,为研究该耐药质粒的跨物种传播及临床风险模式提供支持。 文件详解 Clinical Information.xlsx:Excel格式文件,为去标识化的临床信息数据文件,原含潜在可识别信息的Sample...
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查尔斯王子山脉南极缓步动物线虫轮虫新记录补充数据集
数据集概述 本数据集是预印本论文《Unearthed from old soils: New records of Antarctic tardigrades, nematodes, and rotifers in the Prince-Charles...
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功能性多域人工跨膜转运体设计的生成景观与动力学数据集
数据集概述 该数据集包含用于设计功能性多域人工跨膜转运体的生成景观与动力学相关数据,涵盖LGL代码输入数据、分子动力学(MD)输入文件及实验结果,为相关生物分子设计研究提供数据支持。 文件详解 Experimental-Results.zip: ZIP格式压缩文件,可能包含人工跨膜转运体设计的实验结果数据 MD-inputs.zip:...
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仓鼠基因间序列数据集
数据集概述 本数据集包含为Bgee 15.0版本构建的仓鼠(Mesocricetus auratus)基因间序列数据,基于十六个文库生成。涵盖基因间序列文件、分类统计数据及分布可视化文档,为基因表达分析提供基础数据支持。 文件详解 基因间序列文件: ref_intergenic.fa.gz: GZ压缩的FASTA文件,可能包含参考基因间序列数据...
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结核分枝杆菌复合群最近共同祖先基因组数据集
数据集概述 本数据集包含结核分枝杆菌复合群(MTBC)最近共同祖先的基因组参考序列及相关分析图表,基于2010年发表的研究构建,可用于区分MTBC不同分支的祖先与衍生突变,为结核分枝杆菌进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:MTB_ancestor_reference.fasta 文件格式:FASTA(.fasta)...
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美洲黑松适应性性状全基因组关联遗传学数据集
数据集概述 该数据集围绕美洲黑松球果闭鳞性这一关键适应性性状展开全基因组关联遗传学研究,包含通过限制性酶切与PCR扩增法生成的群体基因组数据,涉及98株样本的95000余个单核苷酸多态性位点,为解析该性状的遗传结构提供支持。 文件详解 REFpine27apr11-0.bam:BAM格式文件,可能为测序比对后的基因组数据文件...
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反向同源性数据与权重数据集
数据集概述 本数据集包含用于研究论文“利用进化对比学习发现内在无序区域分子特征”的训练数据、模型权重、分类数据集及相关文件,覆盖酵母、人类和DisProt数据库的内在无序区域(IDR)同源序列、模型特征与基准测试数据。 文件详解 该数据集由多个文件组成,具体说明如下: - 训练数据文件(.zip格式): -...
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小麦瘟病菌大流行种群基因分型多重扩增子测序数据集
数据集概述 该数据集包含186株稻瘟病菌(同物异名:Pyricularia oryzae)的基因分型数据,样本覆盖孟加拉国(2016-2020年,75株)和赞比亚(2018-2020年,13株)的小麦瘟病流行菌株。数据基于多重扩增子测序技术,选取84个单核苷酸多态性位点,用于区分2016年东南亚出现的小麦瘟病菌克隆谱系与其他基因型。 文件详解...
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BIOCOM_PIPE_ZymoBIOMICS人工微生物群落数据集
数据集概述 本数据集为ZymoBIOMICS提供的人工微生物群落数据,包含8种细菌和2种真菌菌株,涵盖易裂解革兰氏阴性菌、难裂解革兰氏阳性菌及难裂解酵母,提供16S/18S rRNA序列和基因组信息,用于微生物多样性研究。 文件详解 该数据集包含8个文件,具体说明如下: - FASTA格式序列文件(共7个): -...
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历史转座子动员波与作物病原菌适应性变异关联研究补充文件集2025
数据集概述 本数据集为“历史转座子动员波在主要作物病原菌中创造独特适应性变异库”研究的补充文件集,包含转座子多态性检测基准测试、泛基因组组装注释、适应性变异定位等核心研究材料,支持解析病原菌适应性进化机制。 文件详解 README.txt:...
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果蝇寄生蜂分子凭证数据库DROP
数据集概述 该数据集是一个人工整理的开放获取分子参考数据库(DROP),用于果蝇寄生蜂的鉴定。数据库将遗传数据与凭证标本关联,部分标本经分类学家鉴定并与原始模式标本比对,同时包含更新的物种目录,旨在解决果蝇寄生蜂鉴定难题,促进相关研究。 文件详解 说明文档: README.md:Markdown格式的说明文档,包含数据库引用信息、背景介绍及使用指南。...
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Sphaerospora_molnari增殖阶段转录组数据集
数据集概述 本数据集是针对粘孢子虫Sphaerospora molnari增殖阶段的首个转录组数据,通过从头组装方法构建,包含宿主过滤和非宿主过滤的转录本序列,以及补充的qPCR验证文档。核心内容聚焦于该寄生虫感染早期上调的蛋白酶,为研究其宿主利用、免疫逃避机制及潜在药物靶点提供基础数据。 文件详解 文件名称:...
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肺炎支原体全基因组多位点序列分型方案数据集
数据集概述 本数据集包含肺炎支原体全基因组多位点序列分型(wgMLST)方案构建所需的数据,涉及基因组组装文件及最终的wgMLST分型方案,为肺炎支原体的基因分型研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:NCBI_assemblies.zip 文件格式:ZIP压缩包 内容:包含用于构建分型方案的RefSeq登录号列表及基因组组装FASTA文件...



