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Atlantic_mackerel_Transcriptome_SNP_SSR_Markers_2015
数据集概述 本数据集来自论文“Discovery and characterization of 80 SNPs and 1,624 SSRs in the transcriptome of Atlantic mackerel (Scomber scombrus,...
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Phaseolus_vulgaris_Based_乌干达西部农户菜豆种子获取与遗传多样性研究数据
数据集概述 本数据集围绕乌干达西部Hoima地区农户群体的普通菜豆(Phaseolus vulgaris)种子获取及早期采用的遗传模式展开研究,通过4955个SNP标记分析1156份种子样本的分子多样性,包括当地农户样本、育种家选育品种及全球种质资源,对比不同采用行为农户的作物群体结构与遗传多样性差异。 文件详解 文件名称:Wilkus et al....
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RAD_sequencing_Zebra_Finch_Genome_留尼汪灰绣眼鸟SNP标记数据
数据集概述 本数据集通过RAD测序技术结合与斑胸草雀基因组比对,为非模式雀形目鸟类留尼汪灰绣眼鸟生成大量SNP标记。研究使用6个混合样本池测序,构建约60万个contigs,其中38.6万个可比对至斑胸草雀基因组,最终获得8万余个可准确定位且分布均匀的SNP标记,展示了该方法在非模式鸟类中高效开发SNP的潜力。 文件详解...
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DRYAD_Matala_et_al_Rock_Creek流域虹鳟与钢头鳟基因流动研究数据2017
数据集概述 本数据集包含对哥伦比亚河Rock Creek流域虹鳟(Oncorhynchus mykiss)与钢头鳟种群基因流动的研究数据。通过192个SNP标记和5年采样,分析流域上下游虹鳟种群的时空遗传结构,探究季节性河床干旱导致的基因流动限制及自然屏障对基因分化的影响,为渔业保护提供遗传依据。 文件详解...
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Ecol_Apps_Morissette_et_al_2019_湖鳟生态型环境互作与营养生态位数据
数据集概述 本数据集围绕湖鳟(Salvelinus namaycush)的生态型-环境互作展开,包含养殖、本地及杂交个体的稳定同位素分析数据,以及遗传标记与生态性状关联分析结果,旨在研究养殖对种内营养生态位分化的影响,为渔业管理和保护提供数据支持。 文件详解 说明文档类...
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Deciphering_Genomic_Architecture_九刺鱼脑结构多基因座定位研究数据
数据集概述 本数据集来自九刺鱼脑基因组结构研究,通过新型多基因座QTL定位方法,分析九刺鱼脑大小及五个脑区的遗传结构。研究基于239个F2代个体、15198个SNP标记,识别出79个相关QTL,揭示脑性状由多小效应位点控制,为鱼类脑功能与适应性进化的遗传机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:QTL_brain.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Anthropocene_Population_Genomics_纽约都市圈白足鼠基因组变异数据集
数据集概述 本数据集记录纽约市都市圈23个白足鼠种群的基因组变异情况,通过ddRAD-Seq技术生成超10000个SNP标记,分析城市化梯度(不透水面覆盖率、人口密度)对种群基因组多样性、分化模式的影响,含基因组数据压缩包及样本文件共4个。 文件详解 文件名称:wfm191vcf.zip 文件格式:ZIP...
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Trachycarpus_fortunei_Based_瑞士南部及意大利北部入侵群体遗传标记分析数据
数据集概述 本数据集为论文配套数据,包含入侵棕榈Trachycarpus fortunei在瑞士南部及意大利北部群体的微卫星与SNP标记分析结果,记录了208个样本的基因型数据,用于揭示该物种的随机交配模式和主动殖民过程,是研究其入侵机制的核心遗传信息资源。 文件详解 GBS分析文件 文件名称:variants.vcf.gz 文件格式:VCF.GZ...
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Lolium_perenne_Rabier_etal_2015_Based_基因组选择准确性研究数据
数据集概述 本数据集为《On the accuracy of genomic selection》研究相关数据,聚焦通过高密度标记预测选择候选育种值的基因组选择技术,包含理论准确性表达式、新代理指标及多年生黑麦草(367个个体、24,957个SNP标记)的实证分析数据,用于验证基因组选择准确性方法的有效性。 文件详解...
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Symmetrical_Onychomadesis_GWAS_Dogs_犬对称性爪脱落症基因研究数据
数据集概述 本数据集包含犬对称性爪脱落症(一种导致健康犬周期性脱爪的疾病)的全基因组关联研究数据。通过对225只戈登塞特犬的分析,在12号染色体上定位到约3.3Mb的关联区域;结合英国塞特犬的元分析显示该区域同样与该病相关。数据支持犬类该病的遗传标记筛选与育种应用。 文件详解 Dogs.map 文件格式:.map...
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Rye600K_SNP_Based_黑麦600K_SNP阵列标记_Lo7_参考基因组定位数据2017
数据集概述 本数据集包含Bauer等人2017年开发的黑麦600K SNP阵列标记在'Lo7'染色体级参考基因组上的定位数据。通过NCBI blastn工具比对600843个SNP标记序列,经严格过滤后得到精确位置信息,为黑麦基因组学研究提供基础资源。 文件详解 文件名称:Rye600K_SNP_Array_Lo7Map.xlsx 文件格式:XLSX...
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Eragrostis_tef_Based_埃塞俄比亚画眉草水分胁迫下生产力与形态生理性状基因组解析数据
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚画眉草(Eragrostis tef)在不同水分条件下的基因组与表型研究数据,包含297个基因型的28,837个SNP标记数据,以及2020-2021年两个生长季、两种水分处理(充足/有限)下的生产力、抗倒伏性及形态生理性状表型数据,用于解析目标性状的遗传基础。 文件详解 ReadMe for Zenodo.txt...
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Armillaria_cepistipes_SSR_SNP_Based真菌种群遗传结构比较评估原始数据
数据集概述 本数据集为评估SSR和SNP两种分子标记在推断真菌Armillaria...
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Potamopyrgus_antipodarum_Based淡水螺有性无性谱系核质基因组不一致性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦新西兰淡水螺Potamopyrgus antipodarum,通过核单核苷酸多态性(SNP)标记和线粒体基因,分析其有性与无性谱系的核质基因组不一致性,探究无性谱系起源时间、生态进化过程对繁殖方式演化的影响,包含3个相关文件。 文件详解 文件名称:README_for_SNPgen_ploidy_hapl.doc...
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白鲟_Acipenser_sturio_遗传监测单核苷酸多态性_SNP_与短串联重复序列_STR_比较数据
数据集概述 本数据集为极危物种欧洲鲟(Acipenser sturio)的遗传监测研究数据,包含通过ddRAD测序发现的79个SNP标记及其与传统STR标记的对比分析结果,涉及195尾已知谱系幼鱼和40尾野生成鱼的基因分型数据,用于评估两种标记在亲缘关系鉴定、近交系数估计等保护遗传学应用中的有效性。 文件详解 GENOYPES 40 SAMPLES...
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Supplementary_material_1_意大利阿尔卑斯棕熊非侵入性样本SNP标记亲子鉴定补充材料
数据集概述 本数据集是论文“Performance of SNP markers for parentage analysis in the Italian Alpine brown bear using non-invasive...
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数据2017年DRYAD数据库中基于生态型的兰花属植物_Epipactis_helleborine_生殖隔离研究数据
数据集概述 本数据集围绕森林与沙丘生态型的Epipactis helleborine(兰科植物)展开,通过受控杂交、种子萌发实验及遗传形态分析,验证菌根群落差异对生殖隔离的影响,包含移民种子活力、杂交种子活力、遗传标记及形态特征等核心研究数据。 文件详解 文件名称:DRYAD_Jacquemyn et al. 2017.xlsx 文件格式:XLSX...
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白额黑雁迁徙传统改变的遗传后果数据集
数据集概述 本数据集围绕白额黑雁迁徙传统改变的遗传后果展开,包含对格陵兰、斯匹次卑尔根、俄罗斯、瑞典及荷兰(后两者为新出现种群)418个个体的358个SNP标记基因分型数据,用于分析种群遗传结构、基因流及连锁不平衡等。 文件详解 统计分析文件:...
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八倍体草莓基因组结构与SNP标记数据集
数据集概述 本数据集围绕八倍体草莓(包括栽培草莓和野生种)的基因组结构、亚基因组变异及SNP标记展开,包含SNP基因分型数据、遗传图谱、探针信息及补充材料,为研究草莓染色体演化、亚基因组结构及遗传标记开发提供支持。 文件详解 基因分型数据文件: SNPcalls.850K_genotypes.txt:TXT格式,包含850K...
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德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究补充数据集
数据集概述 本数据集是《德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究》论文的补充数据,包含基因组测序、样本信息、系统发育树及图表等多类型文件,为理解该病原菌的分子流行病学特征提供支持。 文件详解 数据概览文件: 00_Campylobacter fetus_data_overview.csv:CSV格式,提供样本基本信息的汇总概览...



