找到67个数据集

格式: ZIP 标签: 基因组

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  • Archaea_Genome_古菌基因组核心通路编码序列解构数据

    2026年1月28日 30 109 30

    数据集概述 本数据集为古菌基因组核心通路编码序列解构分析结果,包含71种古菌(覆盖不同分类类群与生理类型)的基因组数据及5条核心通路的编码序列分析文件,涉及密码子使用模式、密码子对偏好等研究内容,可用于探究古菌核心通路编码序列的组装策略与共识特征。 文件详解 压缩文件(Archive files) 文件名称:All 71 genomes 5...
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  • Anammox_微生物基因组研究_厌氧氨氧化细菌电子受体补充数据

    2026年1月27日 30 76 34

    数据集概述 本数据集是关于厌氧氨氧化(anammox)细菌电子受体研究的补充数据,包含2个Excel补充表格和1个宏基因组氨基酸序列文件。研究聚焦于厌氧氨氧化细菌最初以一氧化氮(NO)为电子受体的假设,通过比较基因组学分析了相关基因的水平转移,并验证了菌群的代谢活性,为理解厌氧氨氧化细菌的进化和代谢机制提供支持。 文件详解...
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  • Patric_Based_哥伦比亚幽门螺杆菌公共数据库基因组信息数据集

    2026年1月26日 30 167 69

    数据集概述 本数据集整理了2020年7月从公共数据库获取的哥伦比亚幽门螺杆菌(H.pylori)基因组相关信息,包含样本的人口统计学特征、临床信息及基因组组装统计数据,为研究该细菌的基因组特征提供结构化参考,共涉及1个文件。 文件详解 文件名称:Genomas colombianos de H. pylori depositados en NCBI...
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  • Genomic_Data_Uploading_基因组数据上传压缩文件

    2026年1月25日 30 45 30

    数据集概述 本数据集为基因组数据上传相关的压缩文件,包含一个压缩包文件,无训练测试、数据标签或原始处理数据的划分,未检测到命名模式,无目录结构,未提供自述文件或内容预览。 文件详解 文件名称:Genomic Data Uploading.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:未提供具体字段信息,为单一压缩包文件,无内容预览。 适用场景...
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  • turtle_genomic_Based龟类进化多样化基因组研究数据

    2026年1月25日 30 53 22

    数据集概述 本数据集为龟类进化多样化的基因组研究数据,包含19个代表性龟类基因组的单拷贝直系同源基因、26个龟类物种的二代测序标记,以及系统发育分析结果。数据用于探究龟类进化中的系统发育异质性、基因树-物种树冲突等问题,共17个文件,涵盖对齐序列、基因树、物种树、日志及补充表格等内容。 文件详解 压缩包文件(.zip/.tar.gz)...
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  • 盐祖蛛科_Salticidae_锚定杂交富集研究补充材料数据_2017年

    2026年1月21日 30 6 5

    数据集概述 本数据集为跳蛛基因组系统发育研究的补充材料,包含34种跳蛛分类单元和12种外群分类单元的测序组装统计数据,涉及原始读数、基因座、序列长度等关键指标,是该研究的重要支撑数据。 文件详解 文件名称:oo_153922.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Dryad_Based_Dendrogramma物种系统发育基因组研究数据

    2026年1月21日 30 45 38

    数据集概述 本数据集为Dendrogramma物种的系统发育基因组研究数据,包含新采集标本的相关数据文件。Dendrogramma曾被认为是全新门级生物,本研究通过数据表明其属于刺胞动物门管水母目Rhodaliidae科的底栖管水母。数据集含五个文件,用于支持该物种分类的研究分析。 文件详解...
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  • Parus_major_Based_野生鸟类群体基因组遗传变异分区分析数据

    2026年1月21日 30 206 34

    数据集概述 本数据集聚焦野生大山雀(Parus major)种群,通过多标记方法分析基因组遗传变异在数量性状中的分布。数据包含2497只个体的表型信息与5591个基因组标记数据,验证了动物育种相关方法在生态研究种群中的适用性,揭示了翅长性状的多基因遗传模式与性别染色体效应。 文件详解 表型数据文件...
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  • Katz_Grant_Based_真核生物系统发育基因组分析及子采样研究数据

    2026年1月20日 30 67 61

    数据集概述 本数据集来自真核生物系统发育基因组分析研究,包含232种真核生物、486种细菌和84种古菌的基因组数据,涉及1554个垂直遗传基因。数据支持五大真核生物分支(变形虫界、 excavata、后鞭毛生物、原始色素体生物、SAR超类群)的关系解析,分析了内共生基因转移(EGT)对系统发育的影响,并验证了位点抽样在系统发育分析中的优势。 文件详解...
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  • Villiers等人急性早幼粒细胞白血病PML_RARA基因调控多组学源数据

    2026年1月20日 30 67 2

    数据集概述 本数据集是论文“Multi-omics and machine learning reveal context-specific gene regulatory activities of PML::RARA in Acute Promyelocytic...
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  • Oligohymenophorea_PL0344_微生物基因组转录组测序数据

    2026年1月20日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含Oligohymenophorea sp. PL0344的基因组与转录组测序数据,以压缩包形式存储,无分层目录结构及数据划分,未提供说明文档或内容预览。 文件详解 文件名称:Oligohymenophorea_PL0344.zip 文件格式:ZIP...
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  • Thalassiosirales_硅藻_海洋淡水过渡_系统发育基因组学研究数据

    2026年1月19日 30 64 36

    数据集概述 本数据集为硅藻(主要是盘藻目Thalassiosirales)海洋淡水过渡研究的补充材料,包含59个硅藻类群的基因组与转录组系统发育数据,用于解析其栖息地转换的进化机制,涉及基因树冲突、祖先状态重建及适应性基因分析等内容。 文件详解 README-dryad.txt 文件格式:TXT...
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  • Phylogenetic_Data_系统发育信号分析_串联比对与基因树研究数据

    2026年1月19日 30 70 15

    数据集概述 本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析,包含原核生物3个分类深度(γ变形菌、变形菌、原核生物)的248个基因树(315个基因组),以及真核生物2个分类深度(动植物真菌跨类群、真菌内部)的279个基因树(85个基因组),用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。 文件详解...
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  • Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据

    2026年1月18日 30 35 32

    数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件(UCE)诱饵集,包含36个半翅目样本(覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属)及1个缨翅目外群的UCE数据,同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果,可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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  • Rosa_Supplementary_Material_玫瑰基因组代谢物分析补充数据

    2026年1月18日 30 39 32

    数据集概述 本数据集为论文《The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses》的补充材料,包含通过GC-MS技术对6个玫瑰品种、3种植物部位进行的靶向代谢物分析数据,支持玫瑰基因组研究及驯化机制分析。 文件详解 文件名称:Supplementary...
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  • Birkbeck_Thesis_Supplemental_Tables_结核分枝杆菌研究数据

    2026年1月17日 30 130 26

    数据集概述 本数据集是伦敦大学伯克贝克学院博士论文的补充表格数据,围绕结核分枝杆菌复合体的宿主特异性及非编码RNA的作用展开,采用基因组和转录组学方法研究。包含12个Excel格式的补充表格文件,为论文研究提供结构化支撑数据。 文件详解...
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  • 线虫反义转录进化研究数据_Pristionchus_pacificus_2016年

    2026年1月15日 30 21 16

    数据集概述 本数据集基于线虫Pristionchus pacificus的链特异性RNA-seq文库测序结果,包含1112个反义转录结构配置信息,核心为465个嵌入宿主基因内含子的反义转录本(ASTs)。同时涵盖20种线虫基因组反义基因对的进化分析数据,涉及vps-4、ddx-27等保守基因座的结构变化研究。 文件详解...
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  • Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据

    2026年1月14日 30 116 47

    数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制,通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异,识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路,包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征,为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称:33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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  • snakes_phylogenomics_Based_蛇类科间系统发育基因组关系研究数据

    2026年1月13日 30 62 43

    数据集概述 本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据,包含3776个核基因座的超保守元件序列,涉及29种蛇类(覆盖几乎所有科),是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系,揭示了3个新分支,为脊椎动物系统发育研究提供支撑。 文件详解 序列文件(.phy格式)...
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  • CBGP_Inrae_Source_蚜虫线粒体核共生体基因组系统发育研究补充数据_2024

    2026年1月13日 30 11 5

    数据集概述 本数据集为论文“蚜虫系统发育中线粒体、核与共生体基因组的不一致性:谁在说真话?”的补充数据,包含补充表格、补充图表、实验方案文档及4个存档文件,覆盖蚜虫样本信息、基因扩增数据、基因组矩阵、系统发育树及共生菌基因组草案等内容,支持蚜虫系统发育的多组学分析。 文件详解 补充表格文件 文件名称:Supplementary_Tables.xlsx...
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