-
GAP_20_磷_GAP_20机器学习力场参数与参考数据库
2026年1月30日 30 58 49
数据集概述 本数据集包含论文“A general-purpose machine-learning force field for bulk and nanostructured phosphorus”（待发表）中描述的磷的机器学习力场参数文件及参考数据库，共5个文件，涵盖.xml、.xyz等格式，用于磷材料的模拟计算。 文件详解 力场参数文件...
-
Martini_Based_核酸珠子形状因子SAXS精修输入文件
2026年1月28日 30 78 17
数据集概述 本数据集为论文“Martini bead form factors for nucleic-acids and their application in the refinement of protein/nucleic-acid complexes against SAXS...
-
Cellulose_Based_纤维素单链溶解计算研究补充材料数据
2026年1月27日 30 89 51
数据集概述 本数据集为论文“Computational study of the dissolution of cellulose into single chains: the role of the solvent and...
-
GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据
2026年1月9日 30 141 119
数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
-
DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_Based_磷脂双分子层动力学模拟完整数据
2025年12月21日 30 27 5
数据集概述 该数据集包含1摩尔浓度氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟条件为323K，含72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对钠氯离，轨迹时长120纳秒，分析最后60纳秒数据。 文件详解 模拟参数与配置文件： md.mdp：模拟参数文件，记录模拟条件设置...
-
鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制分子动力学模拟数据集
2025年12月19日 30 80 20
数据集概述 本数据集包含鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制研究的分子动力学模拟快照及力场拓扑文件。核心内容为模拟得到的三种结合模式（ROT1、pre-redox、ROT2）的蛋白质-配体结构，以及GROMACS格式的鱼藤酮及其衍生物的力场参数文件，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 分子模拟快照文件（位于configurations/目录下）:...
-
胶原蛋白结构与动力学全原子力场评估及优化数据集
2025年12月9日 30 99 0
数据集概述 本数据集是为发表于《Biophysical Journal》的研究论文“Evaluation and refinement of all-atom force fields for reproducing collagen structure and dynamics”提供的配套数据，聚焦胶原蛋白结构与动力学的全原子力场评估及优化研究。...
-
DPPC_Berger_OPLS06_NaCl分子动力学模拟数据集
2025年12月5日 60 191 20
数据集概述 本数据集包含使用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场进行的、含150mM NaCl的完全水合DPPC双层膜分子动力学模拟轨迹及相关文件，模拟条件为323K、72个脂质分子、2880个SPC水分子及8个Na和Cl离子，轨迹时长120ns，分析了最后60ns数据。 文件详解 模拟配置文件：...
-
DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集
2025年12月6日 30 120 58
数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
-
Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据
2025年12月6日 30 11 1
数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件，采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成，离子电荷缩放系数为0.7，提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件，存储120ns模拟的原子坐标信息...
