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Carex_Based_苔草属DNA序列系统发育研究补充数据
2026年1月29日 30 11 9
数据集概述 本数据集为苔草属（Carex）首个大规模系统发育研究的补充数据，基于996个物种（占公认物种的50.23%）的ITS、ETS和matK三个DNA区域序列构建超级矩阵。数据包含系统发育树、DNA序列文件及分类单元列表，支持对苔草属早期分化结构、分类单元单系性的分析，挑战部分传统进化假说。 文件详解 系统发育树文件...
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hym_v2_Bait_Set_蚂蚁膜翅目基因组系统发育研究数据
2026年1月28日 30 178 72
数据集概述 本数据集包含用于研究蚂蚁和膜翅目基因组系统发育的增强型UCE诱饵集及相关分析数据。通过优化UCE基因座识别和诱饵设计流程，新增2590个膜翅目UCE基因座，覆盖16/17蚂蚁亚科的84个分类群数据，验证了高捕获成功率，支持系统发育树构建，并整合传统标记生成综合蚂蚁系统发育数据。 文件详解 文件名称：appendix2-supporting-...
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Ledebouriinae_Based_植物历史生物地理学研究数据
2026年1月27日 30 10 1
数据集概述 本数据集为Ledebouriinae属（天门冬科绵枣儿亚科）的历史生物地理学研究数据，涵盖195个类群（含86个内群类群）的系统发育重建、分化时间估算及生物地理分析结果，包含23个相关文件，支持探究该类群在撒哈拉以南非洲、马达加斯加及欧亚大陆的分布历史与演化机制。 文件详解 文档类文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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菲洛多利亚属微型飞蛾在夏威夷沉没岛屿上的起源与宏观进化_研究数据集
2026年1月27日 30 32 22
数据集概述 本数据集聚焦夏威夷特有潜叶蛾属Philodoria的起源与宏进化研究，包含基于锚定杂交富集技术构建的首个夏威夷动物类群系统发育基因组数据集（507个基因位点），以及相关的基因覆盖度、年代校准和系统发育树文件，共6份文件。 文件详解 基因序列数据文件 文件名称：ESM4-Dataset1_FcC_supermatrix_507_AA.nex...
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Ant_Agriculture_Based_蚂蚁农业进化与真菌驯化研究数据
2026年1月21日 30 142 75
数据集概述 本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开，包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史，探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程，共包含八个文件，以压缩包为主。 文件详解 生物地理与性状多样化文件（biogeo-trait-diversification-files.zip） 文件格式：ZIP...
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NCBI_GenBank_Based_红藻源复杂质体进化模型与定年研究数据
2026年1月21日 30 188 50
数据集概述 本数据集为红藻源复杂质体进化模型与定年研究的支撑数据，包含经处理的蛋白质序列比对文件、原始序列文件及物种-蛋白质对应矩阵。数据选取自NCBI RefSeq和GenBank数据库，涵盖112种生物的97个保守质体编码蛋白氨基酸序列，用于系统发育和分子钟分析。 文件详解 序列比对文件包（SequenceAlignments.zip）...
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Microhylidae_Based_马达加斯加窄口蛙分子系统发育与分类数据
2026年1月20日 30 2 0
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加窄口蛙（Microhylidae科）的分子系统发育、形态分化及分类研究展开，整合了相关研究中的分子数据与形态学数据，基于11个基因位点的超级矩阵提出新的系统发育树，并结合骨骼学数据集讨论分类修订，涉及属级分类调整及新属建立。 文件详解 文件名称：cophyline microhylids.zip 文件格式：ZIP...
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Sulawesi_Based_苏拉威西特有松鼠进化史研究数据_博物馆标本测序
2026年1月20日 30 92 91
数据集概述 本数据集为基于博物馆标本测序的苏拉威西特有松鼠进化史研究数据，包含全线粒体基因组和核超保守元件（UCEs）数据，用于构建系统发育树，探究其适应辐射历史、类群分化时间及核质基因树冲突机制，共含9个文件。 文件详解 信息统计文件 文件名称：FcC_info.xls 文件格式：XLS 字段映射介绍：推测包含测序样本信息、基因位点统计等基础数据...
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Abelisauridae_Based葡萄牙晚侏罗世兽脚类恐龙牙齿形态测量与系统发育研究数据
2026年1月17日 30 159 31
数据集概述 本数据集为葡萄牙晚侏罗世兽脚类恐龙牙齿的古生物学研究数据，包含4颗孤立牙齿的形态测量、分类编码及系统发育分析相关文件，支持基于牙齿特征的兽脚类恐龙分类鉴定与系统发育关系研究，共4个文件。 文件详解 文件名称：Teeth character codings.xlsx 文件格式：XLSX...
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Odontoceti_echolocating_whales_齿鲸颅骨伸缩进化研究数据集
2026年1月13日 30 159 60
数据集概述 本数据集聚焦齿鲸（回声定位鲸类）颅骨伸缩进化研究，涵盖4000万年鲸类进化历程中的3D颅骨扫描数据。通过滑动半地标形态测量、祖先特征状态重建及进化模型拟合，分析颅骨后移与面部骨骼重叠的形态变异，揭示齿鲸颅骨伸缩的进化模式。数据集含4个文件，支持进化生物学与形态学研究。 文件详解 文件名称：Appendix D...
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Liliales_Phylogenomics_Based植物系统发育与历史生物地理学研究数据
2026年1月12日 30 18 15
数据集概述 本数据集包含百合目（Liliales）10个科的系统基因组学与历史生物地理学研究数据，基于35种29属百合目植物的75个质体基因及97个被子植物质体基因组，通过超级矩阵方法扩展至58属，结合17个化石日期校准进化时间线，揭示百合目起源于澳大利亚及通过南极洲的洲际分布历史。 文件详解 文件名称：135_Angiosperm_75CDS.nex...
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Dryad_Bivalvia_Phylogenetic_Backbone_RNA_seq_研究数据
2026年1月7日 30 128 24
数据集概述 本数据集为双壳类（Bivalvia）系统发育研究的RNA-seq数据，包含31种双壳类的转录组数据及已发表基因组、转录组数据。通过系统发育基因组学分析，构建了双壳类可靠的系统发育框架，解决了原鳃亚纲、异齿亚纲等类群的单系性及古异齿亚纲等类群的系统位置问题，可支持宏观进化理论验证。 文件详解 文档文件...
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面包果属_Artocarpus_Moraceae_系统发育研究数据集
2025年12月21日 30 122 116
数据集概述 该数据集包含面包果属（Artocarpus）517基因的系统发育研究数据，覆盖96%的类群，整合新鲜叶片与博物馆标本（最长106年）的DNA序列。内容涉及序列组装、基因树分析、分区策略等，为该属分类修订及目标富集数据研究提供基础。 文件详解 数据集包含10个文件，具体说明如下： -...
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甲虫多样性进化与基因组基础数据集
2025年12月19日 30 17 15
数据集概述 本数据集围绕甲虫多样性的进化与基因组基础展开，包含四个子数据集（Dataset S1-S4），涉及植物细胞壁降解酶相关的基因树、Blast比对结果、候选基因序列及超级矩阵等内容，为甲虫进化与功能基因研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含四个独立的ZIP压缩文件，具体说明如下： -...
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蛰针类蜂类系统发育基因组学研究数据集
2025年12月13日 30 109 27
数据集概述 本数据集基于超保守元件（UCE）系统发育基因组学技术，针对蛰针类蜂类（Aculeata）家族间关系展开研究，涉及187个样本、超800个UCE位点序列数据，旨在明确蚂蚁和蜜蜂的系统发育亲缘关系，为理解社会演化模式及食性转变提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多个压缩包、表格和文档文件，具体说明如下： - 序列数据与比对文件: - uce-...
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莎草科系统发育研究超级矩阵方法数据集
2025年12月12日 30 22 9
数据集概述 本数据集围绕莎草科（Cyperaceae）系统发育研究展开，包含基于超级矩阵方法构建的系统发育树文件、基因序列比对数据、分析脚本及附录文档，支持探究超级矩阵方法在系统发育推断中的应用价值。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共5个）：...
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果蝇螺旋体共生体快速分子进化研究数据集
2025年12月10日 30 124 33
数据集概述 本数据集包含支持“果蝇螺旋体共生体快速分子进化”研究的相关数据文件，包括序列、比对结果、分析方案及实验协议等，可用于复现论文中的研究发现。 文件详解 OTU_sequences.fasta：FASTA格式文件，包含所有经PfamScan预测含OTU结构域的螺旋体序列...
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多足类系统发育关系及矩阵组成与基因占有率对系统发育重建影响数据集
2025年12月8日 30 10 8
数据集概述 本数据集围绕多足类（包括蜈蚣、马陆等）的系统发育关系展开，通过分析40个转录组数据，构建不同基因占有率（50%、75%、90%）的超级矩阵，探究矩阵组成、基因进化速率等因素对系统发育重建的影响，为解决多足类内部类群关系争议提供数据支持。 文件详解 该数据集包含7个PDF格式的补充文件，具体说明如下： -...
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昆虫物种水平生命树构建及分类分析应用数据集
2025年12月7日 30 64 13
数据集概述 本数据集围绕昆虫物种水平生命树构建展开，包含49,358个物种、13,865个属、760个科的系统发育数据。通过优化的核转录组、线粒体基因组及物种标记矩阵构建流程，结合分层推断方法生成生命树，为昆虫多样性研究及分类分析提供基础。 文件详解 物种树文件：...
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系统发育组学超级矩阵推断的系统发育平台感知数据结构附录
2025年12月7日 30 66 2
数据集概述 本数据集是关于系统发育组学研究的附录文件，内容围绕“系统发育平台感知（PTA）数据结构”展开，该结构用于在分区模型下高效分析超级矩阵，可利用数据缺失情况下的（部分）平台和诱导分区树节省计算时间，提升系统发育推断效率。 文件详解 文件名称: Online-Appendix-Chernomor_et_al.pdf 文件格式: PDF...
