数据集概述
本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开，包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史，探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程，共包含八个文件，以压缩包为主。
文件详解
- 生物地理与性状多样化文件（biogeo-trait-diversification-files.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含用于分析生物地理与性状多样化的相关数据
- 补充表格（supplementary-tables.xls）
- 文件格式：XLS
- 内容说明：研究相关的补充表格数据
- 未修剪的UCE序列比对文件（uce-alignments-untrimmed.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：超保守元件（UCE）位点的未修剪序列比对数据
- Trinity组装序列文件（all-trinity-contigs.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：Trinity组装得到的所有序列数据
- 分区方案文件（attine-118t-f75-partitioning-schames.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：用于系统发育分析的分区方案数据
- BEAST分析文件（beast-xml-files.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：BEAST软件分析所需的XML格式文件
- 系统发育树文件（phylogenetic-trees.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：重建的蚂蚁进化史系统发育树数据
- 比对超级矩阵文件（alignment-supermatrices.zip）
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：序列比对的超级矩阵数据
适用场景
- 蚂蚁农业进化研究：分析真菌种植蚂蚁农业系统的演化历程与驯化机制
- 生物地理学分析：探究蚂蚁农业起源与栖息地偏好的地理分布规律
- 基因组学研究：利用UCE位点与组装序列数据开展蚂蚁基因组进化分析
- 系统发育树构建：基于分区方案与超级矩阵数据重建蚂蚁系统发育关系
- 真菌驯化环境研究：验证季节性干燥栖息地对真菌驯化的影响机制
