数据集概述
本数据集基于超保守元件(UCE)系统发育基因组学技术,针对蛰针类蜂类(Aculeata)家族间关系展开研究,涉及187个样本、超800个UCE位点序列数据,旨在明确蚂蚁和蜜蜂的系统发育亲缘关系,为理解社会演化模式及食性转变提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多个压缩包、表格和文档文件,具体说明如下:
- 序列数据与比对文件:
- uce-aligments-untrimmed-unfiltered.zip: ZIP格式压缩包,包含未修剪、未过滤的UCE序列比对数据
- all-alignment-supermatrices.zip: ZIP格式压缩包,包含所有比对超级矩阵数据
- uce-loci-extracted-from-genome-enabled-samples.zip: ZIP格式压缩包,从基因组样本中提取的UCE位点数据
- trinity-assemblies-all-samples.zip: ZIP格式压缩包,所有样本的Trinity组装结果
- 分析结果文件:
- all-beast-xml-files.zip: ZIP格式压缩包,所有BEAST分析的XML配置文件
- all-phylogenetic-trees-results.zip: ZIP格式压缩包,所有系统发育树分析结果
- bacoca-results.xlsx: XLSX格式表格,Bacoca分析结果数据
- 综合数据文件:
- all-tables.xlsx: XLSX格式表格,包含研究相关的所有表格数据
- 补充材料文件:
- supplemental-figure-complete.pdf: PDF格式文档,完整的补充图表
适用场景
- 昆虫系统发育研究: 解析蛰针类蜂类高级阶元关系,重建蚂蚁和蜜蜂的系统发育位置
- 社会演化分析: 探究从肉食性到花粉摄食的食性转变及社会行为演化模式
- 基因组学方法验证: 评估超保守元件(UCE)技术在昆虫系统发育基因组学中的应用效果
- 生物多样性研究: 为理解陆地生态系统中昆虫类群的演化历史提供数据支持