数据集概述
本数据集围绕甲虫多样性的进化与基因组基础展开，包含四个子数据集（Dataset S1-S4），涉及植物细胞壁降解酶相关的基因树、Blast比对结果、候选基因序列及超级矩阵等内容，为甲虫进化与功能基因研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含四个独立的ZIP压缩文件，具体说明如下：
- Dataset_S1_Pfam_Candidate_Genes_trees_and_phy.zip：
- 文件格式：ZIP压缩包
- 内容：植物细胞壁降解酶系统发育分析的基因树数据，包含ML分析用的Phylip格式文件、带TBE和IQtree ML自举支持的基因树文件（对应图S15-S26）。
- Dataset_S2_Blast_10best_hits_Pfam_Candidate_Genes.zip：
- 文件格式：ZIP压缩包
- 内容：转录组和基因组中提取的植物细胞壁降解酶序列的Blast比对结果（前10个最佳匹配）。
- Dataset_S3_Pfam_Candidate_Genes_Fas.zip：
- 文件格式：ZIP压缩包
- 内容：转录组和基因组中提取的植物细胞壁降解酶候选基因/转录本序列（过滤前）。
- Dataset_S4_Supermatrices_partitions.zip：
- 文件格式：ZIP压缩包
- 内容：图1和图S10对应的超级矩阵（Phylip格式）、超级矩阵的分区方案文件（如Fig_1_Partition_finder_best_scheme等）。
适用场景
- 进化生物学研究：分析甲虫植物细胞壁降解酶基因的进化历史与多样性形成机制
- 功能基因组学研究：探究甲虫适应不同生境的功能基因（如植物细胞壁降解酶）的分子基础
- 系统发育分析：基于基因树与超级矩阵数据构建甲虫相关类群的系统发育关系
- 比较基因组学分析：通过Blast结果与候选基因序列，比较不同甲虫物种的基因组特征
