数据集概述
该数据集围绕澳大利亚蜥蜴属（Cryptoblepharus）的系统发育研究，通过筛选约2000个外显子基因座，分析基因树分辨率对基于合并模型的物种树推断的影响，探索拓扑结构和支持度变化，为基因组数据的系统发育分析方法优化提供依据。
文件详解
- 压缩文件（.gz格式）：
- ASTRAL_0_indiv_miss_allowed_RANKED.tar.gz：可能包含允许个体缺失的排序基因树的ASTRAL物种树分析结果
- RAxML.tar.gz：可能包含使用RAxML软件进行的基因树或物种树推断结果
- ASTRAL_1_indiv_miss_allowed_RANKED.tar.gz：可能包含另一种个体缺失设置下的排序基因树ASTRAL分析结果
- 1852_exon_cap_alignments.tar.gz：包含1852个外显子捕获序列的比对文件
- ASTRAL_1_indiv_miss_allowed_RANDOM.tar.gz：可能包含随机选取基因树的ASTRAL分析结果
- ASTRAL_0_indiv_miss_allowed_RANDOM.tar.gz：可能包含另一种设置下随机选取基因树的ASTRAL分析结果
- 文档与图表文件：
- supp_figures_V2.pdf：补充图表文件，包含研究相关的可视化结果
- Supplementary_Table_1.doc：补充表格1，可能包含基因座筛选、分辨率统计等详细数据
适用场景
- 系统发育学研究：分析基因树不确定性对物种树推断的影响机制
- 基因组数据分析方法优化：评估基因树分辨率筛选策略在合并模型中的应用价值
- 生物信息学工具验证：验证ASTRAL、RAxML等软件在复杂类群系统发育推断中的表现
- 进化生物学研究：探究澳大利亚蜥蜴属的物种形成与演化关系
- 分子系统学方法学研究：为处理基因组数据中的系统发育信号异质性提供案例参考
