数据集概述
本数据集为Leptonetid科蜘蛛的系统基因组学与生物地理学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）构建的“宽松”和“严格”两种数据矩阵，以及系统发育分析、分子定年、生物地理推断等相关结果文件，共11个文件，支持该科蜘蛛的分类修订、演化历史及分布格局研究。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：READMELedfordetal2021.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、文件清单及各文件内容概述
- 表格类文件
- 文件名称：1._SupplementaryTables.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充表格，包含样本采集地信息等辅助数据
- 系统发育分析结果文件
- 文件名称：4._RAxML_bipartitions.gtrg_partxlocus_looseGBlocks.tre、5._RAxML_bipartitions.gtrg_partxlocus_strictGBlocks.tre、10._MCMCTree_chronogram.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：系统发育树文件，分别为宽松GBlocks设置下的RAxML结果、严格GBlocks设置下的RAxML结果、分子定年分析得到的时间树
- 数据矩阵文件
- 文件名称：2._DataMatrix408_36_IntronExon.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：包含408个基因座和36个分类单元的序列数据矩阵，保留内含子和外显子区域
- 压缩包类文件
- 文件名称：3._ExcludedLoci.zip、6._SVDQuartets_looseGBlocks.zip、7._SVDQuartets_strictGBlocks.zip、8._gcf_scf_looseGBlocks.zip、9._gcf_scf_strictGBlocks.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别为因 paralogy 排除的基因座文件、宽松/严格GBlocks设置下的SVDQuartets分析结果、宽松/严格GBlocks设置下的基因座筛选结果
数据来源
Dryad Repository（论文：Ledford, J.M.等2021年发表的《Phylogenomics and biogeography of leptonetid spiders (Araneae: Leptonetidae)》）
适用场景
- 蜘蛛分类学研究：支持Leptonetid科蜘蛛的分类修订，验证亚科及属级分类单元的单系性
- 系统发育演化分析：利用两种数据矩阵及系统发育树结果，探究该科蜘蛛的演化关系与分化时间
- 生物地理学研究：结合分子定年和DEC分析结果，推断Leptonetid科蜘蛛的祖先分布区及分布格局形成机制
- 基因组数据应用：基于超保守元件（UCEs）数据，开展蜘蛛基因组水平的演化分析方法验证
